Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Q5

Clic1, Chloride intracellular channel protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clic1Q9Z1Q5 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Clic1Q9Z1Q5 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Clic1Q9Z1Q5 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Clic1Q9Z1Q5 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Clic1Q9Z1Q5 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Clic1Q9Z1Q5 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Clic1Q9Z1Q5 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Clic1Q9Z1Q5 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Clic1Q9Z1Q5 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Clic1Q9Z1Q5 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Clic1Q9Z1Q5 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Clic1Q9Z1Q5 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Clic1Q9Z1Q5 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Clic1Q9Z1Q5 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Clic1Q9Z1Q5 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Clic1Q9Z1Q5 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Clic1Q9Z1Q5 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Clic1Q9Z1Q5 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Clic1Q9Z1Q5 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Clic1Q9Z1Q5 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Clic1Q9Z1Q5 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Clic1Q9Z1Q5 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Clic1Q9Z1Q5 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Clic1Q9Z1Q5 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Clic1Q9Z1Q5 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Clic1Q9Z1Q5 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Clic1Q9Z1Q5 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Clic1Q9Z1Q5 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Clic1Q9Z1Q5 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Clic1Q9Z1Q5 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Clic1Q9Z1Q5 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Clic1Q9Z1Q5 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Clic1Q9Z1Q5 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Clic1Q9Z1Q5 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Clic1Q9Z1Q5 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Clic1Q9Z1Q5 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Clic1Q9Z1Q5 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Clic1Q9Z1Q5 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Clic1Q9Z1Q5 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Clic1Q9Z1Q5 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Clic1Q9Z1Q5 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Clic1Q9Z1Q5 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Clic1Q9Z1Q5 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Clic1Q9Z1Q5 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Clic1Q9Z1Q5 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Clic1Q9Z1Q5 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Clic1Q9Z1Q5 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Clic1Q9Z1Q5 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Clic1Q9Z1Q5 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Clic1Q9Z1Q5 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Clic1Q9Z1Q5 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Clic1Q9Z1Q5 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Clic1Q9Z1Q5 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Clic1Q9Z1Q5 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Clic1Q9Z1Q5 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Clic1Q9Z1Q5 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Clic1Q9Z1Q5 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Clic1Q9Z1Q5 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Clic1Q9Z1Q5 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Clic1Q9Z1Q5 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Clic1Q9Z1Q5 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Clic1Q9Z1Q5 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Clic1Q9Z1Q5 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Clic1Q9Z1Q5 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Clic1Q9Z1Q5 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Clic1Q9Z1Q5 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Clic1Q9Z1Q5 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Clic1Q9Z1Q5 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Clic1Q9Z1Q5 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Clic1Q9Z1Q5 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Clic1Q9Z1Q5 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Clic1Q9Z1Q5 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Clic1Q9Z1Q5 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Clic1Q9Z1Q5 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Clic1Q9Z1Q5 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Clic1Q9Z1Q5 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Clic1Q9Z1Q5 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Clic1Q9Z1Q5 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Clic1Q9Z1Q5 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Clic1Q9Z1Q5 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Clic1Q9Z1Q5 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Clic1Q9Z1Q5 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Clic1Q9Z1Q5 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Clic1Q9Z1Q5 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Clic1Q9Z1Q5 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Clic1Q9Z1Q5 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Clic1Q9Z1Q5 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Clic1Q9Z1Q5 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Clic1Q9Z1Q5 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Clic1Q9Z1Q5 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Clic1Q9Z1Q5 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Clic1Q9Z1Q5 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Clic1Q9Z1Q5 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Clic1Q9Z1Q5 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Clic1Q9Z1Q5 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Clic1Q9Z1Q5 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Clic1Q9Z1Q5 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Clic1Q9Z1Q5 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Clic1Q9Z1Q5 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Clic1Q9Z1Q5 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.1 ms