Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z179

Shcbp1, SHC SH2 domain-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 668 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shcbp1Q9Z179 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Shcbp1Q9Z179 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Shcbp1Q9Z179 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Shcbp1Q9Z179 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Shcbp1Q9Z179 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Shcbp1Q9Z179 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Shcbp1Q9Z179 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Shcbp1Q9Z179 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Shcbp1Q9Z179 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Shcbp1Q9Z179 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Shcbp1Q9Z179 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Shcbp1Q9Z179 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Shcbp1Q9Z179 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Shcbp1Q9Z179 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Shcbp1Q9Z179 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Shcbp1Q9Z179 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Shcbp1Q9Z179 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Shcbp1Q9Z179 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Shcbp1Q9Z179 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Shcbp1Q9Z179 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Shcbp1Q9Z179 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Shcbp1Q9Z179 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Shcbp1Q9Z179 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Shcbp1Q9Z179 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Shcbp1Q9Z179 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Shcbp1Q9Z179 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Shcbp1Q9Z179 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Shcbp1Q9Z179 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Shcbp1Q9Z179 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Shcbp1Q9Z179 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Shcbp1Q9Z179 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Shcbp1Q9Z179 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Shcbp1Q9Z179 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Shcbp1Q9Z179 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Shcbp1Q9Z179 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Shcbp1Q9Z179 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Shcbp1Q9Z179 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Shcbp1Q9Z179 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Shcbp1Q9Z179 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Shcbp1Q9Z179 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Shcbp1Q9Z179 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Shcbp1Q9Z179 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Shcbp1Q9Z179 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Shcbp1Q9Z179 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Shcbp1Q9Z179 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Shcbp1Q9Z179 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Shcbp1Q9Z179 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Shcbp1Q9Z179 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Shcbp1Q9Z179 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Shcbp1Q9Z179 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Shcbp1Q9Z179 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Shcbp1Q9Z179 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Shcbp1Q9Z179 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Shcbp1Q9Z179 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Shcbp1Q9Z179 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC18■□□□□ 0.47
Shcbp1Q9Z179 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Shcbp1Q9Z179 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Shcbp1Q9Z179 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Shcbp1Q9Z179 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Shcbp1Q9Z179 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Shcbp1Q9Z179 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Shcbp1Q9Z179 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Shcbp1Q9Z179 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Shcbp1Q9Z179 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Shcbp1Q9Z179 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Shcbp1Q9Z179 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Shcbp1Q9Z179 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Shcbp1Q9Z179 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Shcbp1Q9Z179 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Shcbp1Q9Z179 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Shcbp1Q9Z179 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Shcbp1Q9Z179 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Shcbp1Q9Z179 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Shcbp1Q9Z179 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Shcbp1Q9Z179 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Shcbp1Q9Z179 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Shcbp1Q9Z179 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Shcbp1Q9Z179 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Shcbp1Q9Z179 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Shcbp1Q9Z179 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Shcbp1Q9Z179 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Shcbp1Q9Z179 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Shcbp1Q9Z179 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Shcbp1Q9Z179 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Shcbp1Q9Z179 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Shcbp1Q9Z179 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Shcbp1Q9Z179 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Shcbp1Q9Z179 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Shcbp1Q9Z179 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Shcbp1Q9Z179 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Shcbp1Q9Z179 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Shcbp1Q9Z179 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Shcbp1Q9Z179 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Shcbp1Q9Z179 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Shcbp1Q9Z179 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Shcbp1Q9Z179 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Shcbp1Q9Z179 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Shcbp1Q9Z179 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Shcbp1Q9Z179 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Shcbp1Q9Z179 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms