Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z140

Cpne6, Copine-6, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne6Q9Z140 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cpne6Q9Z140 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cpne6Q9Z140 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cpne6Q9Z140 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cpne6Q9Z140 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cpne6Q9Z140 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cpne6Q9Z140 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cpne6Q9Z140 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cpne6Q9Z140 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cpne6Q9Z140 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cpne6Q9Z140 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cpne6Q9Z140 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cpne6Q9Z140 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Cpne6Q9Z140 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cpne6Q9Z140 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cpne6Q9Z140 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cpne6Q9Z140 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cpne6Q9Z140 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cpne6Q9Z140 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cpne6Q9Z140 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cpne6Q9Z140 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cpne6Q9Z140 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cpne6Q9Z140 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cpne6Q9Z140 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cpne6Q9Z140 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cpne6Q9Z140 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cpne6Q9Z140 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cpne6Q9Z140 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cpne6Q9Z140 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cpne6Q9Z140 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cpne6Q9Z140 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cpne6Q9Z140 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cpne6Q9Z140 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cpne6Q9Z140 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cpne6Q9Z140 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cpne6Q9Z140 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cpne6Q9Z140 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cpne6Q9Z140 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cpne6Q9Z140 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cpne6Q9Z140 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cpne6Q9Z140 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cpne6Q9Z140 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cpne6Q9Z140 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cpne6Q9Z140 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cpne6Q9Z140 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cpne6Q9Z140 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Cpne6Q9Z140 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cpne6Q9Z140 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cpne6Q9Z140 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cpne6Q9Z140 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cpne6Q9Z140 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Cpne6Q9Z140 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cpne6Q9Z140 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cpne6Q9Z140 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cpne6Q9Z140 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cpne6Q9Z140 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cpne6Q9Z140 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cpne6Q9Z140 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cpne6Q9Z140 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Cpne6Q9Z140 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cpne6Q9Z140 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Cpne6Q9Z140 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cpne6Q9Z140 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cpne6Q9Z140 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cpne6Q9Z140 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cpne6Q9Z140 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cpne6Q9Z140 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cpne6Q9Z140 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cpne6Q9Z140 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Cpne6Q9Z140 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cpne6Q9Z140 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cpne6Q9Z140 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cpne6Q9Z140 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cpne6Q9Z140 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cpne6Q9Z140 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cpne6Q9Z140 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cpne6Q9Z140 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cpne6Q9Z140 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cpne6Q9Z140 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cpne6Q9Z140 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cpne6Q9Z140 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cpne6Q9Z140 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cpne6Q9Z140 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cpne6Q9Z140 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cpne6Q9Z140 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cpne6Q9Z140 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cpne6Q9Z140 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cpne6Q9Z140 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cpne6Q9Z140 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cpne6Q9Z140 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cpne6Q9Z140 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cpne6Q9Z140 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cpne6Q9Z140 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cpne6Q9Z140 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cpne6Q9Z140 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Cpne6Q9Z140 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cpne6Q9Z140 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cpne6Q9Z140 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cpne6Q9Z140 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cpne6Q9Z140 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms