Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0T9

Itgb6, Integrin beta-6, mousemouse

Predictions only

Length 787 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb6Q9Z0T9 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Itgb6Q9Z0T9 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Itgb6Q9Z0T9 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Itgb6Q9Z0T9 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Itgb6Q9Z0T9 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Itgb6Q9Z0T9 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Itgb6Q9Z0T9 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Itgb6Q9Z0T9 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Itgb6Q9Z0T9 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Itgb6Q9Z0T9 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Itgb6Q9Z0T9 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Itgb6Q9Z0T9 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Itgb6Q9Z0T9 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Itgb6Q9Z0T9 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Itgb6Q9Z0T9 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Itgb6Q9Z0T9 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Itgb6Q9Z0T9 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Itgb6Q9Z0T9 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Itgb6Q9Z0T9 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Itgb6Q9Z0T9 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Itgb6Q9Z0T9 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Itgb6Q9Z0T9 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Itgb6Q9Z0T9 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Itgb6Q9Z0T9 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Itgb6Q9Z0T9 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Itgb6Q9Z0T9 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Itgb6Q9Z0T9 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Itgb6Q9Z0T9 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Itgb6Q9Z0T9 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Itgb6Q9Z0T9 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Itgb6Q9Z0T9 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Itgb6Q9Z0T9 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Itgb6Q9Z0T9 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Itgb6Q9Z0T9 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Itgb6Q9Z0T9 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Itgb6Q9Z0T9 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Itgb6Q9Z0T9 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Itgb6Q9Z0T9 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Itgb6Q9Z0T9 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Itgb6Q9Z0T9 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Itgb6Q9Z0T9 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Itgb6Q9Z0T9 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Itgb6Q9Z0T9 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Itgb6Q9Z0T9 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Itgb6Q9Z0T9 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Itgb6Q9Z0T9 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Itgb6Q9Z0T9 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Itgb6Q9Z0T9 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Itgb6Q9Z0T9 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Itgb6Q9Z0T9 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Itgb6Q9Z0T9 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Itgb6Q9Z0T9 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Itgb6Q9Z0T9 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Itgb6Q9Z0T9 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Itgb6Q9Z0T9 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Itgb6Q9Z0T9 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Itgb6Q9Z0T9 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Itgb6Q9Z0T9 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Itgb6Q9Z0T9 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Itgb6Q9Z0T9 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Itgb6Q9Z0T9 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Itgb6Q9Z0T9 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Itgb6Q9Z0T9 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Itgb6Q9Z0T9 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Itgb6Q9Z0T9 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Itgb6Q9Z0T9 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Itgb6Q9Z0T9 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Itgb6Q9Z0T9 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Itgb6Q9Z0T9 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Itgb6Q9Z0T9 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Itgb6Q9Z0T9 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Itgb6Q9Z0T9 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Itgb6Q9Z0T9 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Itgb6Q9Z0T9 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Itgb6Q9Z0T9 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Itgb6Q9Z0T9 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Itgb6Q9Z0T9 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Itgb6Q9Z0T9 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Itgb6Q9Z0T9 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Itgb6Q9Z0T9 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Itgb6Q9Z0T9 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Itgb6Q9Z0T9 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Itgb6Q9Z0T9 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Itgb6Q9Z0T9 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Itgb6Q9Z0T9 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Itgb6Q9Z0T9 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Itgb6Q9Z0T9 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Itgb6Q9Z0T9 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Itgb6Q9Z0T9 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Itgb6Q9Z0T9 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Itgb6Q9Z0T9 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Itgb6Q9Z0T9 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Itgb6Q9Z0T9 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Itgb6Q9Z0T9 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Itgb6Q9Z0T9 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Itgb6Q9Z0T9 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Itgb6Q9Z0T9 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Itgb6Q9Z0T9 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Itgb6Q9Z0T9 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Itgb6Q9Z0T9 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms