Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0S4

Cldn13, Claudin-13, mousemouse

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Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn13Q9Z0S4 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn13Q9Z0S4 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn13Q9Z0S4 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn13Q9Z0S4 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn13Q9Z0S4 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn13Q9Z0S4 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn13Q9Z0S4 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn13Q9Z0S4 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn13Q9Z0S4 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn13Q9Z0S4 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn13Q9Z0S4 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn13Q9Z0S4 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn13Q9Z0S4 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn13Q9Z0S4 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn13Q9Z0S4 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn13Q9Z0S4 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn13Q9Z0S4 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn13Q9Z0S4 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn13Q9Z0S4 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn13Q9Z0S4 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn13Q9Z0S4 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn13Q9Z0S4 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn13Q9Z0S4 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn13Q9Z0S4 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn13Q9Z0S4 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn13Q9Z0S4 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn13Q9Z0S4 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Cldn13Q9Z0S4 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn13Q9Z0S4 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn13Q9Z0S4 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn13Q9Z0S4 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn13Q9Z0S4 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn13Q9Z0S4 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn13Q9Z0S4 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn13Q9Z0S4 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn13Q9Z0S4 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn13Q9Z0S4 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn13Q9Z0S4 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cldn13Q9Z0S4 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cldn13Q9Z0S4 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cldn13Q9Z0S4 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cldn13Q9Z0S4 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cldn13Q9Z0S4 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cldn13Q9Z0S4 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cldn13Q9Z0S4 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cldn13Q9Z0S4 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
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Cldn13Q9Z0S4 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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Cldn13Q9Z0S4 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cldn13Q9Z0S4 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cldn13Q9Z0S4 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cldn13Q9Z0S4 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
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Cldn13Q9Z0S4 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldn13Q9Z0S4 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Cldn13Q9Z0S4 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Cldn13Q9Z0S4 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldn13Q9Z0S4 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Cldn13Q9Z0S4 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Cldn13Q9Z0S4 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldn13Q9Z0S4 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cldn13Q9Z0S4 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cldn13Q9Z0S4 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cldn13Q9Z0S4 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cldn13Q9Z0S4 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cldn13Q9Z0S4 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Cldn13Q9Z0S4 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cldn13Q9Z0S4 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cldn13Q9Z0S4 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cldn13Q9Z0S4 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cldn13Q9Z0S4 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cldn13Q9Z0S4 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Cldn13Q9Z0S4 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Cldn13Q9Z0S4 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cldn13Q9Z0S4 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Cldn13Q9Z0S4 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cldn13Q9Z0S4 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cldn13Q9Z0S4 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms