Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVB4

Slit3, Slit homolog 3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,523 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slit3Q9WVB4 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Slit3Q9WVB4 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Slit3Q9WVB4 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Slit3Q9WVB4 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Slit3Q9WVB4 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Slit3Q9WVB4 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Slit3Q9WVB4 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Slit3Q9WVB4 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Slit3Q9WVB4 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Slit3Q9WVB4 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Slit3Q9WVB4 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Slit3Q9WVB4 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Slit3Q9WVB4 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Slit3Q9WVB4 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Slit3Q9WVB4 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Slit3Q9WVB4 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Slit3Q9WVB4 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
Slit3Q9WVB4 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Slit3Q9WVB4 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Slit3Q9WVB4 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Slit3Q9WVB4 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Slit3Q9WVB4 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Slit3Q9WVB4 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Slit3Q9WVB4 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Slit3Q9WVB4 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Slit3Q9WVB4 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Slit3Q9WVB4 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Slit3Q9WVB4 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Slit3Q9WVB4 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Slit3Q9WVB4 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Slit3Q9WVB4 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Slit3Q9WVB4 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Slit3Q9WVB4 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Slit3Q9WVB4 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Slit3Q9WVB4 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Slit3Q9WVB4 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Slit3Q9WVB4 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Slit3Q9WVB4 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Slit3Q9WVB4 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Slit3Q9WVB4 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Slit3Q9WVB4 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Slit3Q9WVB4 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Slit3Q9WVB4 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Slit3Q9WVB4 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Slit3Q9WVB4 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Slit3Q9WVB4 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Slit3Q9WVB4 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Slit3Q9WVB4 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Slit3Q9WVB4 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Slit3Q9WVB4 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Slit3Q9WVB4 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Slit3Q9WVB4 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Slit3Q9WVB4 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Slit3Q9WVB4 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Slit3Q9WVB4 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Slit3Q9WVB4 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Slit3Q9WVB4 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Slit3Q9WVB4 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Slit3Q9WVB4 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Slit3Q9WVB4 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Slit3Q9WVB4 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Slit3Q9WVB4 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Slit3Q9WVB4 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Slit3Q9WVB4 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Slit3Q9WVB4 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Slit3Q9WVB4 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Slit3Q9WVB4 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Slit3Q9WVB4 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Slit3Q9WVB4 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Slit3Q9WVB4 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Slit3Q9WVB4 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Slit3Q9WVB4 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Slit3Q9WVB4 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Slit3Q9WVB4 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Slit3Q9WVB4 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Slit3Q9WVB4 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Slit3Q9WVB4 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Slit3Q9WVB4 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Slit3Q9WVB4 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Slit3Q9WVB4 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Slit3Q9WVB4 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Slit3Q9WVB4 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Slit3Q9WVB4 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Slit3Q9WVB4 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Slit3Q9WVB4 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Slit3Q9WVB4 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Slit3Q9WVB4 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Slit3Q9WVB4 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Slit3Q9WVB4 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Slit3Q9WVB4 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Slit3Q9WVB4 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Slit3Q9WVB4 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Slit3Q9WVB4 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Slit3Q9WVB4 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Slit3Q9WVB4 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Slit3Q9WVB4 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Slit3Q9WVB4 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Slit3Q9WVB4 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Slit3Q9WVB4 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Slit3Q9WVB4 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms