Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV89

Stxbp4, Syntaxin-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stxbp4Q9WV89 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Stxbp4Q9WV89 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Stxbp4Q9WV89 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Stxbp4Q9WV89 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Stxbp4Q9WV89 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Stxbp4Q9WV89 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Stxbp4Q9WV89 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Stxbp4Q9WV89 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Stxbp4Q9WV89 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Stxbp4Q9WV89 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Stxbp4Q9WV89 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC20.64■□□□□ 0.9
Stxbp4Q9WV89 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC20.64■□□□□ 0.9
Stxbp4Q9WV89 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Stxbp4Q9WV89 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Stxbp4Q9WV89 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Stxbp4Q9WV89 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Stxbp4Q9WV89 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Stxbp4Q9WV89 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Stxbp4Q9WV89 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Stxbp4Q9WV89 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Stxbp4Q9WV89 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Stxbp4Q9WV89 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Stxbp4Q9WV89 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Stxbp4Q9WV89 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Stxbp4Q9WV89 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Stxbp4Q9WV89 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Stxbp4Q9WV89 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Stxbp4Q9WV89 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Stxbp4Q9WV89 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Stxbp4Q9WV89 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Stxbp4Q9WV89 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Stxbp4Q9WV89 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Stxbp4Q9WV89 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Stxbp4Q9WV89 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Stxbp4Q9WV89 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Stxbp4Q9WV89 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Stxbp4Q9WV89 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Stxbp4Q9WV89 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Stxbp4Q9WV89 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Stxbp4Q9WV89 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Stxbp4Q9WV89 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Stxbp4Q9WV89 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Stxbp4Q9WV89 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Stxbp4Q9WV89 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Stxbp4Q9WV89 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Stxbp4Q9WV89 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Stxbp4Q9WV89 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Stxbp4Q9WV89 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Stxbp4Q9WV89 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Stxbp4Q9WV89 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Stxbp4Q9WV89 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Stxbp4Q9WV89 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Stxbp4Q9WV89 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Stxbp4Q9WV89 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Stxbp4Q9WV89 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Stxbp4Q9WV89 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Stxbp4Q9WV89 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Stxbp4Q9WV89 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Stxbp4Q9WV89 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Stxbp4Q9WV89 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Stxbp4Q9WV89 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Stxbp4Q9WV89 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Stxbp4Q9WV89 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Stxbp4Q9WV89 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Stxbp4Q9WV89 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Stxbp4Q9WV89 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Stxbp4Q9WV89 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Stxbp4Q9WV89 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Stxbp4Q9WV89 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Stxbp4Q9WV89 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Stxbp4Q9WV89 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Stxbp4Q9WV89 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Stxbp4Q9WV89 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Stxbp4Q9WV89 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Stxbp4Q9WV89 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Stxbp4Q9WV89 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Stxbp4Q9WV89 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Stxbp4Q9WV89 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Stxbp4Q9WV89 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Stxbp4Q9WV89 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Stxbp4Q9WV89 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Stxbp4Q9WV89 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Stxbp4Q9WV89 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Stxbp4Q9WV89 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Stxbp4Q9WV89 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Stxbp4Q9WV89 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Stxbp4Q9WV89 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Stxbp4Q9WV89 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Stxbp4Q9WV89 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Stxbp4Q9WV89 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Stxbp4Q9WV89 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Stxbp4Q9WV89 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Stxbp4Q9WV89 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Stxbp4Q9WV89 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Stxbp4Q9WV89 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Stxbp4Q9WV89 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Stxbp4Q9WV89 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Stxbp4Q9WV89 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Stxbp4Q9WV89 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Stxbp4Q9WV89 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms