Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV80

Snx1, Sorting nexin-1, mousemouse

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx1Q9WV80 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Snx1Q9WV80 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Snx1Q9WV80 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Snx1Q9WV80 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Snx1Q9WV80 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Snx1Q9WV80 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Snx1Q9WV80 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Snx1Q9WV80 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Snx1Q9WV80 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Snx1Q9WV80 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Snx1Q9WV80 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Snx1Q9WV80 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Snx1Q9WV80 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Snx1Q9WV80 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Snx1Q9WV80 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Snx1Q9WV80 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Snx1Q9WV80 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Snx1Q9WV80 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Snx1Q9WV80 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Snx1Q9WV80 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Snx1Q9WV80 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Snx1Q9WV80 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Snx1Q9WV80 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Snx1Q9WV80 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Snx1Q9WV80 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Snx1Q9WV80 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Snx1Q9WV80 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Snx1Q9WV80 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Snx1Q9WV80 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Snx1Q9WV80 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Snx1Q9WV80 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Snx1Q9WV80 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Snx1Q9WV80 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Snx1Q9WV80 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Snx1Q9WV80 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Snx1Q9WV80 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Snx1Q9WV80 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Snx1Q9WV80 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Snx1Q9WV80 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Snx1Q9WV80 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Snx1Q9WV80 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Snx1Q9WV80 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Snx1Q9WV80 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Snx1Q9WV80 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Snx1Q9WV80 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Snx1Q9WV80 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Snx1Q9WV80 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Snx1Q9WV80 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Snx1Q9WV80 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Snx1Q9WV80 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Snx1Q9WV80 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Snx1Q9WV80 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Snx1Q9WV80 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Snx1Q9WV80 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Snx1Q9WV80 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Snx1Q9WV80 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Snx1Q9WV80 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Snx1Q9WV80 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Snx1Q9WV80 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Snx1Q9WV80 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Snx1Q9WV80 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Snx1Q9WV80 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Snx1Q9WV80 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Snx1Q9WV80 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Snx1Q9WV80 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Snx1Q9WV80 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Snx1Q9WV80 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Snx1Q9WV80 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Snx1Q9WV80 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Snx1Q9WV80 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Snx1Q9WV80 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Snx1Q9WV80 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Snx1Q9WV80 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Snx1Q9WV80 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Snx1Q9WV80 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Snx1Q9WV80 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Snx1Q9WV80 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Snx1Q9WV80 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Snx1Q9WV80 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Snx1Q9WV80 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Snx1Q9WV80 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Snx1Q9WV80 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Snx1Q9WV80 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Snx1Q9WV80 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Snx1Q9WV80 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Snx1Q9WV80 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Snx1Q9WV80 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Snx1Q9WV80 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Snx1Q9WV80 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Snx1Q9WV80 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Snx1Q9WV80 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Snx1Q9WV80 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Snx1Q9WV80 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Snx1Q9WV80 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Snx1Q9WV80 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Snx1Q9WV80 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Snx1Q9WV80 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Snx1Q9WV80 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Snx1Q9WV80 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Snx1Q9WV80 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms