Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV55

Vapa, Vesicle-associated membrane protein-associated protein A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VapaQ9WV55 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VapaQ9WV55 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VapaQ9WV55 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VapaQ9WV55 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VapaQ9WV55 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VapaQ9WV55 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
VapaQ9WV55 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VapaQ9WV55 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VapaQ9WV55 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VapaQ9WV55 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VapaQ9WV55 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VapaQ9WV55 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
VapaQ9WV55 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VapaQ9WV55 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VapaQ9WV55 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VapaQ9WV55 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VapaQ9WV55 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
VapaQ9WV55 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
VapaQ9WV55 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VapaQ9WV55 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VapaQ9WV55 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
VapaQ9WV55 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
VapaQ9WV55 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VapaQ9WV55 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
VapaQ9WV55 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VapaQ9WV55 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
VapaQ9WV55 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
VapaQ9WV55 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
VapaQ9WV55 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
VapaQ9WV55 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
VapaQ9WV55 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
VapaQ9WV55 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
VapaQ9WV55 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
VapaQ9WV55 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
VapaQ9WV55 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
VapaQ9WV55 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
VapaQ9WV55 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
VapaQ9WV55 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
VapaQ9WV55 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VapaQ9WV55 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VapaQ9WV55 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VapaQ9WV55 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VapaQ9WV55 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VapaQ9WV55 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VapaQ9WV55 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VapaQ9WV55 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
VapaQ9WV55 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VapaQ9WV55 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VapaQ9WV55 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VapaQ9WV55 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VapaQ9WV55 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VapaQ9WV55 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VapaQ9WV55 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VapaQ9WV55 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VapaQ9WV55 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
VapaQ9WV55 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
VapaQ9WV55 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
VapaQ9WV55 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
VapaQ9WV55 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
VapaQ9WV55 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
VapaQ9WV55 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
VapaQ9WV55 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
VapaQ9WV55 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
VapaQ9WV55 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
VapaQ9WV55 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
VapaQ9WV55 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
VapaQ9WV55 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
VapaQ9WV55 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
VapaQ9WV55 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
VapaQ9WV55 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
VapaQ9WV55 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
VapaQ9WV55 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
VapaQ9WV55 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
VapaQ9WV55 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
VapaQ9WV55 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
VapaQ9WV55 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
VapaQ9WV55 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
VapaQ9WV55 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
VapaQ9WV55 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
VapaQ9WV55 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
VapaQ9WV55 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
VapaQ9WV55 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
VapaQ9WV55 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
VapaQ9WV55 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
VapaQ9WV55 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
VapaQ9WV55 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
VapaQ9WV55 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
VapaQ9WV55 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
VapaQ9WV55 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
VapaQ9WV55 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
VapaQ9WV55 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
VapaQ9WV55 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
VapaQ9WV55 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
VapaQ9WV55 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
VapaQ9WV55 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
VapaQ9WV55 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
VapaQ9WV55 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
VapaQ9WV55 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
VapaQ9WV55 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
VapaQ9WV55 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms