Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUD1

Stub1, STIP1 homology and U box-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stub1Q9WUD1 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Stub1Q9WUD1 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Stub1Q9WUD1 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Stub1Q9WUD1 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Stub1Q9WUD1 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Stub1Q9WUD1 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Stub1Q9WUD1 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Stub1Q9WUD1 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Stub1Q9WUD1 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Stub1Q9WUD1 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Stub1Q9WUD1 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Stub1Q9WUD1 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Stub1Q9WUD1 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Stub1Q9WUD1 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Stub1Q9WUD1 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Stub1Q9WUD1 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Stub1Q9WUD1 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Stub1Q9WUD1 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Stub1Q9WUD1 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Stub1Q9WUD1 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Stub1Q9WUD1 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Stub1Q9WUD1 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Stub1Q9WUD1 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Stub1Q9WUD1 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Stub1Q9WUD1 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Stub1Q9WUD1 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Stub1Q9WUD1 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Stub1Q9WUD1 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Stub1Q9WUD1 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Stub1Q9WUD1 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Stub1Q9WUD1 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Stub1Q9WUD1 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Stub1Q9WUD1 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Stub1Q9WUD1 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Stub1Q9WUD1 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Stub1Q9WUD1 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Stub1Q9WUD1 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Stub1Q9WUD1 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Stub1Q9WUD1 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Stub1Q9WUD1 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Stub1Q9WUD1 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Stub1Q9WUD1 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Stub1Q9WUD1 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Stub1Q9WUD1 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Stub1Q9WUD1 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Stub1Q9WUD1 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Stub1Q9WUD1 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Stub1Q9WUD1 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Stub1Q9WUD1 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Stub1Q9WUD1 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Stub1Q9WUD1 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Stub1Q9WUD1 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Stub1Q9WUD1 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Stub1Q9WUD1 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Stub1Q9WUD1 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Stub1Q9WUD1 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Stub1Q9WUD1 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Stub1Q9WUD1 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Stub1Q9WUD1 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Stub1Q9WUD1 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Stub1Q9WUD1 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Stub1Q9WUD1 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Stub1Q9WUD1 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Stub1Q9WUD1 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Stub1Q9WUD1 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Stub1Q9WUD1 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Stub1Q9WUD1 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Stub1Q9WUD1 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Stub1Q9WUD1 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Stub1Q9WUD1 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Stub1Q9WUD1 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Stub1Q9WUD1 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Stub1Q9WUD1 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Stub1Q9WUD1 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Stub1Q9WUD1 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Stub1Q9WUD1 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Stub1Q9WUD1 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Stub1Q9WUD1 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Stub1Q9WUD1 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Stub1Q9WUD1 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Stub1Q9WUD1 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Stub1Q9WUD1 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Stub1Q9WUD1 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Stub1Q9WUD1 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Stub1Q9WUD1 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Stub1Q9WUD1 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Stub1Q9WUD1 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Stub1Q9WUD1 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Stub1Q9WUD1 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Stub1Q9WUD1 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Stub1Q9WUD1 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Stub1Q9WUD1 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Stub1Q9WUD1 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Stub1Q9WUD1 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Stub1Q9WUD1 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Stub1Q9WUD1 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Stub1Q9WUD1 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Stub1Q9WUD1 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Stub1Q9WUD1 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Stub1Q9WUD1 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms