Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0Q3

Tmed2, Transmembrane emp24 domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed2Q9R0Q3 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tmed2Q9R0Q3 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tmed2Q9R0Q3 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tmed2Q9R0Q3 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tmed2Q9R0Q3 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tmed2Q9R0Q3 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tmed2Q9R0Q3 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tmed2Q9R0Q3 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tmed2Q9R0Q3 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tmed2Q9R0Q3 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tmed2Q9R0Q3 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tmed2Q9R0Q3 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tmed2Q9R0Q3 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tmed2Q9R0Q3 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tmed2Q9R0Q3 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tmed2Q9R0Q3 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tmed2Q9R0Q3 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Tmed2Q9R0Q3 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tmed2Q9R0Q3 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tmed2Q9R0Q3 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tmed2Q9R0Q3 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tmed2Q9R0Q3 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tmed2Q9R0Q3 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tmed2Q9R0Q3 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tmed2Q9R0Q3 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tmed2Q9R0Q3 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tmed2Q9R0Q3 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tmed2Q9R0Q3 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tmed2Q9R0Q3 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tmed2Q9R0Q3 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tmed2Q9R0Q3 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tmed2Q9R0Q3 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tmed2Q9R0Q3 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tmed2Q9R0Q3 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tmed2Q9R0Q3 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tmed2Q9R0Q3 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Tmed2Q9R0Q3 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Tmed2Q9R0Q3 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Tmed2Q9R0Q3 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Tmed2Q9R0Q3 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tmed2Q9R0Q3 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Tmed2Q9R0Q3 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tmed2Q9R0Q3 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tmed2Q9R0Q3 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tmed2Q9R0Q3 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tmed2Q9R0Q3 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Tmed2Q9R0Q3 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tmed2Q9R0Q3 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tmed2Q9R0Q3 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tmed2Q9R0Q3 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tmed2Q9R0Q3 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Tmed2Q9R0Q3 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tmed2Q9R0Q3 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tmed2Q9R0Q3 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tmed2Q9R0Q3 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tmed2Q9R0Q3 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tmed2Q9R0Q3 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Tmed2Q9R0Q3 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Tmed2Q9R0Q3 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tmed2Q9R0Q3 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tmed2Q9R0Q3 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tmed2Q9R0Q3 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tmed2Q9R0Q3 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tmed2Q9R0Q3 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tmed2Q9R0Q3 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tmed2Q9R0Q3 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tmed2Q9R0Q3 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tmed2Q9R0Q3 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tmed2Q9R0Q3 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tmed2Q9R0Q3 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tmed2Q9R0Q3 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tmed2Q9R0Q3 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tmed2Q9R0Q3 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tmed2Q9R0Q3 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tmed2Q9R0Q3 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tmed2Q9R0Q3 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tmed2Q9R0Q3 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tmed2Q9R0Q3 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tmed2Q9R0Q3 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tmed2Q9R0Q3 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tmed2Q9R0Q3 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tmed2Q9R0Q3 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tmed2Q9R0Q3 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tmed2Q9R0Q3 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tmed2Q9R0Q3 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tmed2Q9R0Q3 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tmed2Q9R0Q3 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tmed2Q9R0Q3 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tmed2Q9R0Q3 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tmed2Q9R0Q3 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tmed2Q9R0Q3 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Tmed2Q9R0Q3 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tmed2Q9R0Q3 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tmed2Q9R0Q3 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tmed2Q9R0Q3 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tmed2Q9R0Q3 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tmed2Q9R0Q3 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tmed2Q9R0Q3 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tmed2Q9R0Q3 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tmed2Q9R0Q3 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms