Protein–RNA interactions for Protein: Q9R087

Gpc6, Glypican-6, mousemouse

Predictions only

Length 555 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc6Q9R087 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
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Gpc6Q9R087 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
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Gpc6Q9R087 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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Gpc6Q9R087 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
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Gpc6Q9R087 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gpc6Q9R087 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Gpc6Q9R087 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gpc6Q9R087 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gpc6Q9R087 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gpc6Q9R087 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gpc6Q9R087 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gpc6Q9R087 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gpc6Q9R087 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gpc6Q9R087 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gpc6Q9R087 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gpc6Q9R087 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gpc6Q9R087 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gpc6Q9R087 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gpc6Q9R087 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gpc6Q9R087 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gpc6Q9R087 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gpc6Q9R087 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gpc6Q9R087 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
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