Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZD4

Ercc4, DNA repair endonuclease XPF, mousemouse

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc4Q9QZD4 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ercc4Q9QZD4 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ercc4Q9QZD4 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ercc4Q9QZD4 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ercc4Q9QZD4 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ercc4Q9QZD4 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ercc4Q9QZD4 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ercc4Q9QZD4 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ercc4Q9QZD4 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ercc4Q9QZD4 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ercc4Q9QZD4 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ercc4Q9QZD4 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ercc4Q9QZD4 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ercc4Q9QZD4 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ercc4Q9QZD4 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ercc4Q9QZD4 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ercc4Q9QZD4 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ercc4Q9QZD4 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ercc4Q9QZD4 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Ercc4Q9QZD4 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ercc4Q9QZD4 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ercc4Q9QZD4 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ercc4Q9QZD4 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ercc4Q9QZD4 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Ercc4Q9QZD4 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Ercc4Q9QZD4 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Ercc4Q9QZD4 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Ercc4Q9QZD4 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ercc4Q9QZD4 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ercc4Q9QZD4 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ercc4Q9QZD4 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ercc4Q9QZD4 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ercc4Q9QZD4 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ercc4Q9QZD4 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ercc4Q9QZD4 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ercc4Q9QZD4 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ercc4Q9QZD4 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ercc4Q9QZD4 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ercc4Q9QZD4 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ercc4Q9QZD4 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ercc4Q9QZD4 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ercc4Q9QZD4 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ercc4Q9QZD4 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ercc4Q9QZD4 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ercc4Q9QZD4 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Ercc4Q9QZD4 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Ercc4Q9QZD4 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ercc4Q9QZD4 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ercc4Q9QZD4 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ercc4Q9QZD4 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ercc4Q9QZD4 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ercc4Q9QZD4 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ercc4Q9QZD4 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ercc4Q9QZD4 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ercc4Q9QZD4 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ercc4Q9QZD4 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ercc4Q9QZD4 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ercc4Q9QZD4 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ercc4Q9QZD4 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ercc4Q9QZD4 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ercc4Q9QZD4 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ercc4Q9QZD4 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ercc4Q9QZD4 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ercc4Q9QZD4 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ercc4Q9QZD4 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ercc4Q9QZD4 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ercc4Q9QZD4 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ercc4Q9QZD4 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ercc4Q9QZD4 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ercc4Q9QZD4 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ercc4Q9QZD4 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ercc4Q9QZD4 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ercc4Q9QZD4 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ercc4Q9QZD4 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ercc4Q9QZD4 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ercc4Q9QZD4 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ercc4Q9QZD4 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ercc4Q9QZD4 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ercc4Q9QZD4 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ercc4Q9QZD4 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ercc4Q9QZD4 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Ercc4Q9QZD4 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ercc4Q9QZD4 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ercc4Q9QZD4 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ercc4Q9QZD4 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ercc4Q9QZD4 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ercc4Q9QZD4 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ercc4Q9QZD4 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ercc4Q9QZD4 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ercc4Q9QZD4 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ercc4Q9QZD4 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Ercc4Q9QZD4 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ercc4Q9QZD4 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ercc4Q9QZD4 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ercc4Q9QZD4 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ercc4Q9QZD4 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ercc4Q9QZD4 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ercc4Q9QZD4 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ercc4Q9QZD4 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ercc4Q9QZD4 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms