Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYF9

Ndrg3, Protein NDRG3, mousemouse

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Length 375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndrg3Q9QYF9 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ndrg3Q9QYF9 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ndrg3Q9QYF9 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ndrg3Q9QYF9 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ndrg3Q9QYF9 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ndrg3Q9QYF9 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ndrg3Q9QYF9 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ndrg3Q9QYF9 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ndrg3Q9QYF9 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ndrg3Q9QYF9 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ndrg3Q9QYF9 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ndrg3Q9QYF9 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ndrg3Q9QYF9 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ndrg3Q9QYF9 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ndrg3Q9QYF9 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ndrg3Q9QYF9 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ndrg3Q9QYF9 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ndrg3Q9QYF9 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ndrg3Q9QYF9 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ndrg3Q9QYF9 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ndrg3Q9QYF9 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ndrg3Q9QYF9 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ndrg3Q9QYF9 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ndrg3Q9QYF9 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ndrg3Q9QYF9 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ndrg3Q9QYF9 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ndrg3Q9QYF9 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ndrg3Q9QYF9 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ndrg3Q9QYF9 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ndrg3Q9QYF9 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ndrg3Q9QYF9 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ndrg3Q9QYF9 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ndrg3Q9QYF9 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ndrg3Q9QYF9 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ndrg3Q9QYF9 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ndrg3Q9QYF9 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ndrg3Q9QYF9 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ndrg3Q9QYF9 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Ndrg3Q9QYF9 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ndrg3Q9QYF9 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ndrg3Q9QYF9 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ndrg3Q9QYF9 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ndrg3Q9QYF9 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ndrg3Q9QYF9 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Ndrg3Q9QYF9 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ndrg3Q9QYF9 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ndrg3Q9QYF9 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ndrg3Q9QYF9 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ndrg3Q9QYF9 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ndrg3Q9QYF9 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ndrg3Q9QYF9 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ndrg3Q9QYF9 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ndrg3Q9QYF9 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ndrg3Q9QYF9 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ndrg3Q9QYF9 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ndrg3Q9QYF9 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ndrg3Q9QYF9 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ndrg3Q9QYF9 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Ndrg3Q9QYF9 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Ndrg3Q9QYF9 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ndrg3Q9QYF9 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Ndrg3Q9QYF9 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ndrg3Q9QYF9 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ndrg3Q9QYF9 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Ndrg3Q9QYF9 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Ndrg3Q9QYF9 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ndrg3Q9QYF9 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ndrg3Q9QYF9 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ndrg3Q9QYF9 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ndrg3Q9QYF9 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ndrg3Q9QYF9 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ndrg3Q9QYF9 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ndrg3Q9QYF9 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ndrg3Q9QYF9 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ndrg3Q9QYF9 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ndrg3Q9QYF9 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ndrg3Q9QYF9 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ndrg3Q9QYF9 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ndrg3Q9QYF9 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ndrg3Q9QYF9 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ndrg3Q9QYF9 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ndrg3Q9QYF9 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ndrg3Q9QYF9 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ndrg3Q9QYF9 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms