Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYE3

Bcl11a, B-cell lymphoma/leukemia 11A, mousemouse

Predictions only

Length 773 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bcl11aQ9QYE3 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Bcl11aQ9QYE3 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Bcl11aQ9QYE3 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Bcl11aQ9QYE3 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Bcl11aQ9QYE3 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Bcl11aQ9QYE3 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Bcl11aQ9QYE3 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Bcl11aQ9QYE3 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Bcl11aQ9QYE3 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Bcl11aQ9QYE3 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Bcl11aQ9QYE3 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Bcl11aQ9QYE3 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Bcl11aQ9QYE3 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Bcl11aQ9QYE3 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Bcl11aQ9QYE3 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Bcl11aQ9QYE3 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Bcl11aQ9QYE3 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Bcl11aQ9QYE3 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Bcl11aQ9QYE3 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Bcl11aQ9QYE3 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Bcl11aQ9QYE3 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Bcl11aQ9QYE3 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Bcl11aQ9QYE3 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Bcl11aQ9QYE3 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Bcl11aQ9QYE3 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Bcl11aQ9QYE3 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Bcl11aQ9QYE3 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Bcl11aQ9QYE3 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Bcl11aQ9QYE3 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Bcl11aQ9QYE3 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Bcl11aQ9QYE3 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Bcl11aQ9QYE3 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Bcl11aQ9QYE3 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Bcl11aQ9QYE3 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Bcl11aQ9QYE3 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Bcl11aQ9QYE3 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Bcl11aQ9QYE3 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Bcl11aQ9QYE3 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Bcl11aQ9QYE3 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Bcl11aQ9QYE3 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Bcl11aQ9QYE3 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Bcl11aQ9QYE3 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Bcl11aQ9QYE3 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Bcl11aQ9QYE3 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Bcl11aQ9QYE3 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Bcl11aQ9QYE3 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Bcl11aQ9QYE3 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Bcl11aQ9QYE3 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Bcl11aQ9QYE3 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Bcl11aQ9QYE3 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Bcl11aQ9QYE3 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Bcl11aQ9QYE3 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Bcl11aQ9QYE3 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Bcl11aQ9QYE3 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Bcl11aQ9QYE3 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Bcl11aQ9QYE3 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Bcl11aQ9QYE3 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Bcl11aQ9QYE3 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Bcl11aQ9QYE3 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Bcl11aQ9QYE3 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Bcl11aQ9QYE3 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Bcl11aQ9QYE3 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Bcl11aQ9QYE3 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Bcl11aQ9QYE3 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Bcl11aQ9QYE3 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Bcl11aQ9QYE3 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Bcl11aQ9QYE3 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Bcl11aQ9QYE3 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Bcl11aQ9QYE3 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Bcl11aQ9QYE3 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Bcl11aQ9QYE3 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Bcl11aQ9QYE3 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Bcl11aQ9QYE3 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Bcl11aQ9QYE3 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Bcl11aQ9QYE3 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Bcl11aQ9QYE3 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Bcl11aQ9QYE3 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Bcl11aQ9QYE3 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Bcl11aQ9QYE3 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Bcl11aQ9QYE3 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Bcl11aQ9QYE3 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Bcl11aQ9QYE3 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Bcl11aQ9QYE3 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Bcl11aQ9QYE3 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Bcl11aQ9QYE3 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Bcl11aQ9QYE3 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Bcl11aQ9QYE3 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Bcl11aQ9QYE3 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Bcl11aQ9QYE3 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Bcl11aQ9QYE3 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Bcl11aQ9QYE3 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Bcl11aQ9QYE3 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Bcl11aQ9QYE3 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Bcl11aQ9QYE3 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Bcl11aQ9QYE3 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Bcl11aQ9QYE3 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Bcl11aQ9QYE3 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Bcl11aQ9QYE3 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Bcl11aQ9QYE3 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Bcl11aQ9QYE3 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms