Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY80

Hacd1, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 1, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hacd1Q9QY80 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hacd1Q9QY80 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hacd1Q9QY80 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hacd1Q9QY80 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hacd1Q9QY80 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hacd1Q9QY80 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hacd1Q9QY80 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hacd1Q9QY80 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hacd1Q9QY80 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hacd1Q9QY80 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hacd1Q9QY80 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Hacd1Q9QY80 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hacd1Q9QY80 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hacd1Q9QY80 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hacd1Q9QY80 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hacd1Q9QY80 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hacd1Q9QY80 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hacd1Q9QY80 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hacd1Q9QY80 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hacd1Q9QY80 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hacd1Q9QY80 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hacd1Q9QY80 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hacd1Q9QY80 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hacd1Q9QY80 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hacd1Q9QY80 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hacd1Q9QY80 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hacd1Q9QY80 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hacd1Q9QY80 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hacd1Q9QY80 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hacd1Q9QY80 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hacd1Q9QY80 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hacd1Q9QY80 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hacd1Q9QY80 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hacd1Q9QY80 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hacd1Q9QY80 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hacd1Q9QY80 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hacd1Q9QY80 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hacd1Q9QY80 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hacd1Q9QY80 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hacd1Q9QY80 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hacd1Q9QY80 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hacd1Q9QY80 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hacd1Q9QY80 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Hacd1Q9QY80 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hacd1Q9QY80 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hacd1Q9QY80 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hacd1Q9QY80 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hacd1Q9QY80 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hacd1Q9QY80 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hacd1Q9QY80 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hacd1Q9QY80 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hacd1Q9QY80 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hacd1Q9QY80 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hacd1Q9QY80 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hacd1Q9QY80 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hacd1Q9QY80 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hacd1Q9QY80 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hacd1Q9QY80 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hacd1Q9QY80 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hacd1Q9QY80 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hacd1Q9QY80 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hacd1Q9QY80 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hacd1Q9QY80 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hacd1Q9QY80 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Hacd1Q9QY80 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hacd1Q9QY80 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hacd1Q9QY80 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hacd1Q9QY80 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hacd1Q9QY80 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hacd1Q9QY80 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hacd1Q9QY80 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hacd1Q9QY80 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Hacd1Q9QY80 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hacd1Q9QY80 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hacd1Q9QY80 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hacd1Q9QY80 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hacd1Q9QY80 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hacd1Q9QY80 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hacd1Q9QY80 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hacd1Q9QY80 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hacd1Q9QY80 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hacd1Q9QY80 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hacd1Q9QY80 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Hacd1Q9QY80 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hacd1Q9QY80 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Hacd1Q9QY80 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hacd1Q9QY80 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hacd1Q9QY80 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hacd1Q9QY80 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hacd1Q9QY80 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hacd1Q9QY80 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hacd1Q9QY80 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hacd1Q9QY80 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hacd1Q9QY80 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hacd1Q9QY80 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hacd1Q9QY80 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hacd1Q9QY80 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Hacd1Q9QY80 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hacd1Q9QY80 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hacd1Q9QY80 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms