Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY76

Vapb, Vesicle-associated membrane protein-associated protein B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VapbQ9QY76 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
VapbQ9QY76 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
VapbQ9QY76 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
VapbQ9QY76 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
VapbQ9QY76 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
VapbQ9QY76 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
VapbQ9QY76 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
VapbQ9QY76 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
VapbQ9QY76 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
VapbQ9QY76 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
VapbQ9QY76 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
VapbQ9QY76 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
VapbQ9QY76 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
VapbQ9QY76 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
VapbQ9QY76 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
VapbQ9QY76 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
VapbQ9QY76 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
VapbQ9QY76 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
VapbQ9QY76 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
VapbQ9QY76 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
VapbQ9QY76 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
VapbQ9QY76 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
VapbQ9QY76 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
VapbQ9QY76 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
VapbQ9QY76 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
VapbQ9QY76 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
VapbQ9QY76 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
VapbQ9QY76 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
VapbQ9QY76 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
VapbQ9QY76 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
VapbQ9QY76 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
VapbQ9QY76 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
VapbQ9QY76 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
VapbQ9QY76 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
VapbQ9QY76 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
VapbQ9QY76 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
VapbQ9QY76 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
VapbQ9QY76 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
VapbQ9QY76 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
VapbQ9QY76 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
VapbQ9QY76 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
VapbQ9QY76 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
VapbQ9QY76 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
VapbQ9QY76 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
VapbQ9QY76 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
VapbQ9QY76 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
VapbQ9QY76 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
VapbQ9QY76 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
VapbQ9QY76 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
VapbQ9QY76 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
VapbQ9QY76 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
VapbQ9QY76 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
VapbQ9QY76 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
VapbQ9QY76 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
VapbQ9QY76 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
VapbQ9QY76 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
VapbQ9QY76 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
VapbQ9QY76 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
VapbQ9QY76 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
VapbQ9QY76 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
VapbQ9QY76 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
VapbQ9QY76 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
VapbQ9QY76 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
VapbQ9QY76 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
VapbQ9QY76 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
VapbQ9QY76 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
VapbQ9QY76 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
VapbQ9QY76 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
VapbQ9QY76 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
VapbQ9QY76 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
VapbQ9QY76 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
VapbQ9QY76 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
VapbQ9QY76 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
VapbQ9QY76 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
VapbQ9QY76 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
VapbQ9QY76 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
VapbQ9QY76 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
VapbQ9QY76 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
VapbQ9QY76 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
VapbQ9QY76 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
VapbQ9QY76 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
VapbQ9QY76 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
VapbQ9QY76 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
VapbQ9QY76 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
VapbQ9QY76 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
VapbQ9QY76 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
VapbQ9QY76 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
VapbQ9QY76 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
VapbQ9QY76 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
VapbQ9QY76 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
VapbQ9QY76 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
VapbQ9QY76 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
VapbQ9QY76 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
VapbQ9QY76 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
VapbQ9QY76 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
VapbQ9QY76 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
VapbQ9QY76 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
VapbQ9QY76 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
VapbQ9QY76 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
VapbQ9QY76 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms