Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY61

Irx4, Iroquois-class homeodomain protein IRX-4, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx4Q9QY61 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Irx4Q9QY61 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Irx4Q9QY61 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Irx4Q9QY61 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Irx4Q9QY61 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Irx4Q9QY61 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Irx4Q9QY61 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Irx4Q9QY61 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Irx4Q9QY61 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Irx4Q9QY61 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Irx4Q9QY61 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Irx4Q9QY61 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Irx4Q9QY61 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Irx4Q9QY61 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Irx4Q9QY61 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Irx4Q9QY61 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Irx4Q9QY61 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Irx4Q9QY61 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Irx4Q9QY61 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Irx4Q9QY61 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Irx4Q9QY61 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Irx4Q9QY61 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Irx4Q9QY61 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Irx4Q9QY61 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Irx4Q9QY61 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Irx4Q9QY61 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Irx4Q9QY61 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Irx4Q9QY61 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Irx4Q9QY61 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Irx4Q9QY61 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Irx4Q9QY61 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Irx4Q9QY61 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Irx4Q9QY61 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Irx4Q9QY61 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Irx4Q9QY61 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Irx4Q9QY61 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Irx4Q9QY61 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Irx4Q9QY61 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Irx4Q9QY61 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Irx4Q9QY61 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Irx4Q9QY61 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Irx4Q9QY61 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Irx4Q9QY61 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Irx4Q9QY61 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Irx4Q9QY61 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Irx4Q9QY61 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Irx4Q9QY61 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Irx4Q9QY61 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Irx4Q9QY61 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Irx4Q9QY61 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Irx4Q9QY61 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Irx4Q9QY61 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Irx4Q9QY61 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Irx4Q9QY61 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Irx4Q9QY61 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Irx4Q9QY61 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Irx4Q9QY61 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Irx4Q9QY61 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Irx4Q9QY61 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Irx4Q9QY61 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Irx4Q9QY61 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Irx4Q9QY61 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Irx4Q9QY61 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Irx4Q9QY61 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Irx4Q9QY61 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Irx4Q9QY61 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Irx4Q9QY61 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Irx4Q9QY61 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Irx4Q9QY61 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Irx4Q9QY61 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Irx4Q9QY61 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Irx4Q9QY61 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Irx4Q9QY61 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Irx4Q9QY61 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Irx4Q9QY61 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Irx4Q9QY61 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Irx4Q9QY61 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Irx4Q9QY61 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Irx4Q9QY61 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Irx4Q9QY61 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Irx4Q9QY61 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Irx4Q9QY61 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Irx4Q9QY61 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Irx4Q9QY61 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Irx4Q9QY61 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Irx4Q9QY61 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Irx4Q9QY61 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Irx4Q9QY61 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Irx4Q9QY61 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Irx4Q9QY61 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Irx4Q9QY61 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Irx4Q9QY61 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Irx4Q9QY61 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Irx4Q9QY61 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Irx4Q9QY61 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Irx4Q9QY61 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Irx4Q9QY61 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Irx4Q9QY61 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Irx4Q9QY61 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Irx4Q9QY61 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms