Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY33

Tspan3, Tetraspanin-3, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan3Q9QY33 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tspan3Q9QY33 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tspan3Q9QY33 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Tspan3Q9QY33 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Tspan3Q9QY33 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tspan3Q9QY33 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tspan3Q9QY33 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Tspan3Q9QY33 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tspan3Q9QY33 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tspan3Q9QY33 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tspan3Q9QY33 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tspan3Q9QY33 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tspan3Q9QY33 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tspan3Q9QY33 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tspan3Q9QY33 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tspan3Q9QY33 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tspan3Q9QY33 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tspan3Q9QY33 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tspan3Q9QY33 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tspan3Q9QY33 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Tspan3Q9QY33 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tspan3Q9QY33 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tspan3Q9QY33 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tspan3Q9QY33 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tspan3Q9QY33 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tspan3Q9QY33 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tspan3Q9QY33 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tspan3Q9QY33 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tspan3Q9QY33 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tspan3Q9QY33 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tspan3Q9QY33 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tspan3Q9QY33 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tspan3Q9QY33 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tspan3Q9QY33 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tspan3Q9QY33 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tspan3Q9QY33 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tspan3Q9QY33 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tspan3Q9QY33 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tspan3Q9QY33 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tspan3Q9QY33 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tspan3Q9QY33 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tspan3Q9QY33 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tspan3Q9QY33 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tspan3Q9QY33 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tspan3Q9QY33 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Tspan3Q9QY33 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tspan3Q9QY33 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tspan3Q9QY33 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tspan3Q9QY33 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tspan3Q9QY33 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tspan3Q9QY33 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tspan3Q9QY33 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tspan3Q9QY33 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tspan3Q9QY33 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tspan3Q9QY33 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tspan3Q9QY33 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tspan3Q9QY33 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tspan3Q9QY33 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tspan3Q9QY33 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tspan3Q9QY33 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tspan3Q9QY33 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tspan3Q9QY33 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tspan3Q9QY33 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tspan3Q9QY33 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tspan3Q9QY33 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tspan3Q9QY33 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tspan3Q9QY33 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tspan3Q9QY33 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tspan3Q9QY33 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tspan3Q9QY33 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tspan3Q9QY33 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tspan3Q9QY33 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tspan3Q9QY33 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tspan3Q9QY33 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tspan3Q9QY33 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tspan3Q9QY33 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Tspan3Q9QY33 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Tspan3Q9QY33 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Tspan3Q9QY33 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tspan3Q9QY33 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tspan3Q9QY33 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tspan3Q9QY33 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Tspan3Q9QY33 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tspan3Q9QY33 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tspan3Q9QY33 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tspan3Q9QY33 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tspan3Q9QY33 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tspan3Q9QY33 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tspan3Q9QY33 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tspan3Q9QY33 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tspan3Q9QY33 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tspan3Q9QY33 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tspan3Q9QY33 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tspan3Q9QY33 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tspan3Q9QY33 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tspan3Q9QY33 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tspan3Q9QY33 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tspan3Q9QY33 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tspan3Q9QY33 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tspan3Q9QY33 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms