Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXY6

Ehd3, EH domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 535 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ehd3Q9QXY6 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ehd3Q9QXY6 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ehd3Q9QXY6 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ehd3Q9QXY6 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ehd3Q9QXY6 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ehd3Q9QXY6 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ehd3Q9QXY6 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ehd3Q9QXY6 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ehd3Q9QXY6 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ehd3Q9QXY6 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ehd3Q9QXY6 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ehd3Q9QXY6 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ehd3Q9QXY6 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ehd3Q9QXY6 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ehd3Q9QXY6 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ehd3Q9QXY6 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ehd3Q9QXY6 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ehd3Q9QXY6 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ehd3Q9QXY6 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ehd3Q9QXY6 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ehd3Q9QXY6 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ehd3Q9QXY6 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ehd3Q9QXY6 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Ehd3Q9QXY6 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ehd3Q9QXY6 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Ehd3Q9QXY6 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ehd3Q9QXY6 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Ehd3Q9QXY6 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ehd3Q9QXY6 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ehd3Q9QXY6 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ehd3Q9QXY6 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ehd3Q9QXY6 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ehd3Q9QXY6 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ehd3Q9QXY6 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ehd3Q9QXY6 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ehd3Q9QXY6 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ehd3Q9QXY6 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ehd3Q9QXY6 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ehd3Q9QXY6 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ehd3Q9QXY6 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ehd3Q9QXY6 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ehd3Q9QXY6 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ehd3Q9QXY6 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ehd3Q9QXY6 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ehd3Q9QXY6 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Ehd3Q9QXY6 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ehd3Q9QXY6 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Ehd3Q9QXY6 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ehd3Q9QXY6 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ehd3Q9QXY6 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ehd3Q9QXY6 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ehd3Q9QXY6 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ehd3Q9QXY6 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ehd3Q9QXY6 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ehd3Q9QXY6 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ehd3Q9QXY6 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ehd3Q9QXY6 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ehd3Q9QXY6 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ehd3Q9QXY6 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ehd3Q9QXY6 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ehd3Q9QXY6 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ehd3Q9QXY6 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ehd3Q9QXY6 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ehd3Q9QXY6 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ehd3Q9QXY6 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ehd3Q9QXY6 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ehd3Q9QXY6 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ehd3Q9QXY6 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ehd3Q9QXY6 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ehd3Q9QXY6 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ehd3Q9QXY6 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ehd3Q9QXY6 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ehd3Q9QXY6 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ehd3Q9QXY6 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ehd3Q9QXY6 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ehd3Q9QXY6 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ehd3Q9QXY6 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ehd3Q9QXY6 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ehd3Q9QXY6 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ehd3Q9QXY6 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ehd3Q9QXY6 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ehd3Q9QXY6 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ehd3Q9QXY6 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ehd3Q9QXY6 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ehd3Q9QXY6 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ehd3Q9QXY6 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ehd3Q9QXY6 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ehd3Q9QXY6 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ehd3Q9QXY6 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ehd3Q9QXY6 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ehd3Q9QXY6 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ehd3Q9QXY6 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ehd3Q9QXY6 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ehd3Q9QXY6 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ehd3Q9QXY6 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ehd3Q9QXY6 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ehd3Q9QXY6 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ehd3Q9QXY6 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ehd3Q9QXY6 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ehd3Q9QXY6 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms