Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXD8

Limd1, LIM domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 668 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limd1Q9QXD8 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Limd1Q9QXD8 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Limd1Q9QXD8 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Limd1Q9QXD8 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Limd1Q9QXD8 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Limd1Q9QXD8 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Limd1Q9QXD8 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Limd1Q9QXD8 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Limd1Q9QXD8 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Limd1Q9QXD8 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Limd1Q9QXD8 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Limd1Q9QXD8 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Limd1Q9QXD8 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Limd1Q9QXD8 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Limd1Q9QXD8 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Limd1Q9QXD8 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Limd1Q9QXD8 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Limd1Q9QXD8 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Limd1Q9QXD8 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Limd1Q9QXD8 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Limd1Q9QXD8 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Limd1Q9QXD8 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Limd1Q9QXD8 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Limd1Q9QXD8 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Limd1Q9QXD8 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Limd1Q9QXD8 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Limd1Q9QXD8 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Limd1Q9QXD8 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Limd1Q9QXD8 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Limd1Q9QXD8 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Limd1Q9QXD8 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Limd1Q9QXD8 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Limd1Q9QXD8 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Limd1Q9QXD8 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Limd1Q9QXD8 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Limd1Q9QXD8 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Limd1Q9QXD8 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Limd1Q9QXD8 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Limd1Q9QXD8 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Limd1Q9QXD8 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Limd1Q9QXD8 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Limd1Q9QXD8 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Limd1Q9QXD8 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Limd1Q9QXD8 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Limd1Q9QXD8 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Limd1Q9QXD8 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Limd1Q9QXD8 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Limd1Q9QXD8 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Limd1Q9QXD8 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Limd1Q9QXD8 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Limd1Q9QXD8 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Limd1Q9QXD8 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Limd1Q9QXD8 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Limd1Q9QXD8 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Limd1Q9QXD8 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Limd1Q9QXD8 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Limd1Q9QXD8 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Limd1Q9QXD8 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Limd1Q9QXD8 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Limd1Q9QXD8 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Limd1Q9QXD8 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Limd1Q9QXD8 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Limd1Q9QXD8 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Limd1Q9QXD8 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Limd1Q9QXD8 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Limd1Q9QXD8 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Limd1Q9QXD8 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Limd1Q9QXD8 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Limd1Q9QXD8 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
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Limd1Q9QXD8 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Limd1Q9QXD8 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Limd1Q9QXD8 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Limd1Q9QXD8 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Limd1Q9QXD8 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Limd1Q9QXD8 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Limd1Q9QXD8 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Limd1Q9QXD8 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Limd1Q9QXD8 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Limd1Q9QXD8 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Limd1Q9QXD8 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Limd1Q9QXD8 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Limd1Q9QXD8 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Limd1Q9QXD8 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Limd1Q9QXD8 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Limd1Q9QXD8 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Limd1Q9QXD8 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Limd1Q9QXD8 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Limd1Q9QXD8 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Limd1Q9QXD8 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Limd1Q9QXD8 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Limd1Q9QXD8 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Limd1Q9QXD8 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Limd1Q9QXD8 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Limd1Q9QXD8 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Limd1Q9QXD8 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Limd1Q9QXD8 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Limd1Q9QXD8 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Limd1Q9QXD8 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Limd1Q9QXD8 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
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