Protein–RNA interactions for Protein: Q9QX11

Cyth1, Cytohesin-1, mousemouse

Predictions only

Length 398 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyth1Q9QX11 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cyth1Q9QX11 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cyth1Q9QX11 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cyth1Q9QX11 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cyth1Q9QX11 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Cyth1Q9QX11 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cyth1Q9QX11 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cyth1Q9QX11 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cyth1Q9QX11 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cyth1Q9QX11 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cyth1Q9QX11 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cyth1Q9QX11 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cyth1Q9QX11 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cyth1Q9QX11 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cyth1Q9QX11 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cyth1Q9QX11 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cyth1Q9QX11 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Cyth1Q9QX11 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cyth1Q9QX11 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cyth1Q9QX11 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cyth1Q9QX11 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cyth1Q9QX11 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cyth1Q9QX11 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cyth1Q9QX11 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cyth1Q9QX11 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Cyth1Q9QX11 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cyth1Q9QX11 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cyth1Q9QX11 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Cyth1Q9QX11 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cyth1Q9QX11 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cyth1Q9QX11 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Cyth1Q9QX11 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cyth1Q9QX11 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cyth1Q9QX11 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cyth1Q9QX11 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cyth1Q9QX11 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cyth1Q9QX11 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cyth1Q9QX11 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cyth1Q9QX11 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cyth1Q9QX11 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cyth1Q9QX11 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cyth1Q9QX11 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cyth1Q9QX11 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cyth1Q9QX11 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cyth1Q9QX11 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cyth1Q9QX11 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cyth1Q9QX11 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cyth1Q9QX11 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cyth1Q9QX11 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cyth1Q9QX11 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cyth1Q9QX11 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cyth1Q9QX11 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cyth1Q9QX11 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cyth1Q9QX11 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cyth1Q9QX11 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cyth1Q9QX11 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cyth1Q9QX11 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cyth1Q9QX11 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cyth1Q9QX11 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Cyth1Q9QX11 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cyth1Q9QX11 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cyth1Q9QX11 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cyth1Q9QX11 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cyth1Q9QX11 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Cyth1Q9QX11 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cyth1Q9QX11 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cyth1Q9QX11 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cyth1Q9QX11 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cyth1Q9QX11 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cyth1Q9QX11 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cyth1Q9QX11 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cyth1Q9QX11 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cyth1Q9QX11 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cyth1Q9QX11 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cyth1Q9QX11 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cyth1Q9QX11 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cyth1Q9QX11 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cyth1Q9QX11 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cyth1Q9QX11 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cyth1Q9QX11 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cyth1Q9QX11 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cyth1Q9QX11 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cyth1Q9QX11 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cyth1Q9QX11 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cyth1Q9QX11 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cyth1Q9QX11 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cyth1Q9QX11 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cyth1Q9QX11 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cyth1Q9QX11 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cyth1Q9QX11 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cyth1Q9QX11 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cyth1Q9QX11 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cyth1Q9QX11 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Cyth1Q9QX11 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cyth1Q9QX11 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cyth1Q9QX11 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Cyth1Q9QX11 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cyth1Q9QX11 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Cyth1Q9QX11 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cyth1Q9QX11 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms