Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMK2

Csnk1e, Casein kinase I isoform epsilon, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1eQ9JMK2 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Csnk1eQ9JMK2 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Csnk1eQ9JMK2 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Csnk1eQ9JMK2 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Csnk1eQ9JMK2 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Csnk1eQ9JMK2 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Csnk1eQ9JMK2 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Csnk1eQ9JMK2 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Csnk1eQ9JMK2 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Csnk1eQ9JMK2 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Csnk1eQ9JMK2 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Csnk1eQ9JMK2 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Csnk1eQ9JMK2 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Csnk1eQ9JMK2 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Csnk1eQ9JMK2 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Csnk1eQ9JMK2 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Csnk1eQ9JMK2 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Csnk1eQ9JMK2 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Csnk1eQ9JMK2 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Csnk1eQ9JMK2 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Csnk1eQ9JMK2 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Csnk1eQ9JMK2 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Csnk1eQ9JMK2 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Csnk1eQ9JMK2 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Csnk1eQ9JMK2 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Csnk1eQ9JMK2 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Csnk1eQ9JMK2 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Csnk1eQ9JMK2 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Csnk1eQ9JMK2 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Csnk1eQ9JMK2 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Csnk1eQ9JMK2 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Csnk1eQ9JMK2 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Csnk1eQ9JMK2 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Csnk1eQ9JMK2 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Csnk1eQ9JMK2 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Csnk1eQ9JMK2 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Csnk1eQ9JMK2 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Csnk1eQ9JMK2 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Csnk1eQ9JMK2 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Csnk1eQ9JMK2 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Csnk1eQ9JMK2 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Csnk1eQ9JMK2 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Csnk1eQ9JMK2 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Csnk1eQ9JMK2 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Csnk1eQ9JMK2 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Csnk1eQ9JMK2 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Csnk1eQ9JMK2 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Csnk1eQ9JMK2 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Csnk1eQ9JMK2 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Csnk1eQ9JMK2 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Csnk1eQ9JMK2 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Csnk1eQ9JMK2 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Csnk1eQ9JMK2 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Csnk1eQ9JMK2 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Csnk1eQ9JMK2 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Csnk1eQ9JMK2 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Csnk1eQ9JMK2 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Csnk1eQ9JMK2 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC17.39■□□□□ 0.38
Csnk1eQ9JMK2 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Csnk1eQ9JMK2 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Csnk1eQ9JMK2 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Csnk1eQ9JMK2 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Csnk1eQ9JMK2 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Csnk1eQ9JMK2 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Csnk1eQ9JMK2 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Csnk1eQ9JMK2 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Csnk1eQ9JMK2 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Csnk1eQ9JMK2 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Csnk1eQ9JMK2 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Csnk1eQ9JMK2 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Csnk1eQ9JMK2 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Csnk1eQ9JMK2 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Csnk1eQ9JMK2 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Csnk1eQ9JMK2 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Csnk1eQ9JMK2 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Csnk1eQ9JMK2 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Csnk1eQ9JMK2 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Csnk1eQ9JMK2 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Csnk1eQ9JMK2 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Csnk1eQ9JMK2 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Csnk1eQ9JMK2 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Csnk1eQ9JMK2 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Csnk1eQ9JMK2 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Csnk1eQ9JMK2 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Csnk1eQ9JMK2 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Csnk1eQ9JMK2 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Csnk1eQ9JMK2 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Csnk1eQ9JMK2 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Csnk1eQ9JMK2 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Csnk1eQ9JMK2 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Csnk1eQ9JMK2 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Csnk1eQ9JMK2 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Csnk1eQ9JMK2 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Csnk1eQ9JMK2 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Csnk1eQ9JMK2 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Csnk1eQ9JMK2 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Csnk1eQ9JMK2 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Csnk1eQ9JMK2 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Csnk1eQ9JMK2 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Csnk1eQ9JMK2 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms