Protein–RNA interactions for Protein: Q9JME9

Vstm2b, V-set and transmembrane domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm2bQ9JME9 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vstm2bQ9JME9 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vstm2bQ9JME9 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vstm2bQ9JME9 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vstm2bQ9JME9 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vstm2bQ9JME9 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vstm2bQ9JME9 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vstm2bQ9JME9 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vstm2bQ9JME9 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vstm2bQ9JME9 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vstm2bQ9JME9 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vstm2bQ9JME9 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vstm2bQ9JME9 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vstm2bQ9JME9 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Vstm2bQ9JME9 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vstm2bQ9JME9 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vstm2bQ9JME9 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vstm2bQ9JME9 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vstm2bQ9JME9 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vstm2bQ9JME9 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vstm2bQ9JME9 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vstm2bQ9JME9 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vstm2bQ9JME9 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vstm2bQ9JME9 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vstm2bQ9JME9 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vstm2bQ9JME9 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vstm2bQ9JME9 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vstm2bQ9JME9 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Vstm2bQ9JME9 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Vstm2bQ9JME9 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vstm2bQ9JME9 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vstm2bQ9JME9 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Vstm2bQ9JME9 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Vstm2bQ9JME9 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vstm2bQ9JME9 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vstm2bQ9JME9 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vstm2bQ9JME9 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vstm2bQ9JME9 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vstm2bQ9JME9 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Vstm2bQ9JME9 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vstm2bQ9JME9 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vstm2bQ9JME9 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vstm2bQ9JME9 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vstm2bQ9JME9 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vstm2bQ9JME9 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vstm2bQ9JME9 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vstm2bQ9JME9 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Vstm2bQ9JME9 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vstm2bQ9JME9 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vstm2bQ9JME9 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vstm2bQ9JME9 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vstm2bQ9JME9 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vstm2bQ9JME9 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Vstm2bQ9JME9 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Vstm2bQ9JME9 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Vstm2bQ9JME9 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vstm2bQ9JME9 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vstm2bQ9JME9 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vstm2bQ9JME9 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vstm2bQ9JME9 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vstm2bQ9JME9 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vstm2bQ9JME9 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vstm2bQ9JME9 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vstm2bQ9JME9 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vstm2bQ9JME9 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vstm2bQ9JME9 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vstm2bQ9JME9 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vstm2bQ9JME9 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vstm2bQ9JME9 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vstm2bQ9JME9 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vstm2bQ9JME9 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vstm2bQ9JME9 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vstm2bQ9JME9 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vstm2bQ9JME9 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vstm2bQ9JME9 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Vstm2bQ9JME9 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vstm2bQ9JME9 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vstm2bQ9JME9 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Vstm2bQ9JME9 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vstm2bQ9JME9 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vstm2bQ9JME9 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vstm2bQ9JME9 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Vstm2bQ9JME9 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vstm2bQ9JME9 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vstm2bQ9JME9 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vstm2bQ9JME9 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vstm2bQ9JME9 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vstm2bQ9JME9 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vstm2bQ9JME9 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vstm2bQ9JME9 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vstm2bQ9JME9 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vstm2bQ9JME9 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vstm2bQ9JME9 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vstm2bQ9JME9 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vstm2bQ9JME9 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vstm2bQ9JME9 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Vstm2bQ9JME9 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vstm2bQ9JME9 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vstm2bQ9JME9 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vstm2bQ9JME9 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms