Protein–RNA interactions for Protein: Q9JME7

Trappc2l, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc2lQ9JME7 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Trappc2lQ9JME7 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Trappc2lQ9JME7 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Trappc2lQ9JME7 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Trappc2lQ9JME7 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Trappc2lQ9JME7 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Trappc2lQ9JME7 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Trappc2lQ9JME7 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Trappc2lQ9JME7 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Trappc2lQ9JME7 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Trappc2lQ9JME7 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Trappc2lQ9JME7 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Trappc2lQ9JME7 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Trappc2lQ9JME7 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Trappc2lQ9JME7 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Trappc2lQ9JME7 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Trappc2lQ9JME7 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Trappc2lQ9JME7 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Trappc2lQ9JME7 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Trappc2lQ9JME7 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Trappc2lQ9JME7 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Trappc2lQ9JME7 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Trappc2lQ9JME7 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Trappc2lQ9JME7 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Trappc2lQ9JME7 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Trappc2lQ9JME7 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Trappc2lQ9JME7 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Trappc2lQ9JME7 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Trappc2lQ9JME7 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Trappc2lQ9JME7 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Trappc2lQ9JME7 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Trappc2lQ9JME7 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Trappc2lQ9JME7 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Trappc2lQ9JME7 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Trappc2lQ9JME7 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Trappc2lQ9JME7 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Trappc2lQ9JME7 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Trappc2lQ9JME7 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Trappc2lQ9JME7 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Trappc2lQ9JME7 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Trappc2lQ9JME7 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Trappc2lQ9JME7 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Trappc2lQ9JME7 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Trappc2lQ9JME7 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Trappc2lQ9JME7 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Trappc2lQ9JME7 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Trappc2lQ9JME7 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Trappc2lQ9JME7 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Trappc2lQ9JME7 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Trappc2lQ9JME7 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Trappc2lQ9JME7 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Trappc2lQ9JME7 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Trappc2lQ9JME7 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Trappc2lQ9JME7 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Trappc2lQ9JME7 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Trappc2lQ9JME7 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Trappc2lQ9JME7 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Trappc2lQ9JME7 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Trappc2lQ9JME7 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Trappc2lQ9JME7 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Trappc2lQ9JME7 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Trappc2lQ9JME7 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Trappc2lQ9JME7 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Trappc2lQ9JME7 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Trappc2lQ9JME7 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Trappc2lQ9JME7 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Trappc2lQ9JME7 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Trappc2lQ9JME7 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Trappc2lQ9JME7 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Trappc2lQ9JME7 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Trappc2lQ9JME7 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Trappc2lQ9JME7 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Trappc2lQ9JME7 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Trappc2lQ9JME7 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Trappc2lQ9JME7 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Trappc2lQ9JME7 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Trappc2lQ9JME7 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Trappc2lQ9JME7 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Trappc2lQ9JME7 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Trappc2lQ9JME7 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Trappc2lQ9JME7 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Trappc2lQ9JME7 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Trappc2lQ9JME7 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Trappc2lQ9JME7 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Trappc2lQ9JME7 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Trappc2lQ9JME7 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Trappc2lQ9JME7 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Trappc2lQ9JME7 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Trappc2lQ9JME7 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Trappc2lQ9JME7 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Trappc2lQ9JME7 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Trappc2lQ9JME7 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Trappc2lQ9JME7 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Trappc2lQ9JME7 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Trappc2lQ9JME7 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Trappc2lQ9JME7 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Trappc2lQ9JME7 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Trappc2lQ9JME7 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Trappc2lQ9JME7 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Trappc2lQ9JME7 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms