Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rabgef1Q9JM13 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rabgef1Q9JM13 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rabgef1Q9JM13 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rabgef1Q9JM13 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rabgef1Q9JM13 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rabgef1Q9JM13 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rabgef1Q9JM13 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Rabgef1Q9JM13 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rabgef1Q9JM13 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rabgef1Q9JM13 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rabgef1Q9JM13 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rabgef1Q9JM13 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rabgef1Q9JM13 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rabgef1Q9JM13 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rabgef1Q9JM13 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rabgef1Q9JM13 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rabgef1Q9JM13 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rabgef1Q9JM13 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rabgef1Q9JM13 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rabgef1Q9JM13 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rabgef1Q9JM13 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rabgef1Q9JM13 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rabgef1Q9JM13 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rabgef1Q9JM13 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rabgef1Q9JM13 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rabgef1Q9JM13 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rabgef1Q9JM13 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rabgef1Q9JM13 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rabgef1Q9JM13 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rabgef1Q9JM13 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rabgef1Q9JM13 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rabgef1Q9JM13 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rabgef1Q9JM13 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rabgef1Q9JM13 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rabgef1Q9JM13 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rabgef1Q9JM13 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rabgef1Q9JM13 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Rabgef1Q9JM13 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rabgef1Q9JM13 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Rabgef1Q9JM13 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rabgef1Q9JM13 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rabgef1Q9JM13 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rabgef1Q9JM13 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rabgef1Q9JM13 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rabgef1Q9JM13 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rabgef1Q9JM13 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rabgef1Q9JM13 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rabgef1Q9JM13 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rabgef1Q9JM13 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rabgef1Q9JM13 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rabgef1Q9JM13 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rabgef1Q9JM13 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rabgef1Q9JM13 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rabgef1Q9JM13 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rabgef1Q9JM13 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rabgef1Q9JM13 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rabgef1Q9JM13 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rabgef1Q9JM13 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rabgef1Q9JM13 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rabgef1Q9JM13 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rabgef1Q9JM13 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Rabgef1Q9JM13 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Rabgef1Q9JM13 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rabgef1Q9JM13 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rabgef1Q9JM13 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rabgef1Q9JM13 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rabgef1Q9JM13 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rabgef1Q9JM13 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rabgef1Q9JM13 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rabgef1Q9JM13 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rabgef1Q9JM13 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rabgef1Q9JM13 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rabgef1Q9JM13 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rabgef1Q9JM13 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rabgef1Q9JM13 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rabgef1Q9JM13 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rabgef1Q9JM13 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rabgef1Q9JM13 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rabgef1Q9JM13 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rabgef1Q9JM13 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rabgef1Q9JM13 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rabgef1Q9JM13 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rabgef1Q9JM13 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rabgef1Q9JM13 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rabgef1Q9JM13 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rabgef1Q9JM13 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rabgef1Q9JM13 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rabgef1Q9JM13 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rabgef1Q9JM13 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rabgef1Q9JM13 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rabgef1Q9JM13 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rabgef1Q9JM13 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rabgef1Q9JM13 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rabgef1Q9JM13 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rabgef1Q9JM13 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rabgef1Q9JM13 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Rabgef1Q9JM13 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rabgef1Q9JM13 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rabgef1Q9JM13 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
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