Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLV5

Cul3, Cullin-3, mousemouse

Predictions only

Length 768 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul3Q9JLV5 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cul3Q9JLV5 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cul3Q9JLV5 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cul3Q9JLV5 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cul3Q9JLV5 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cul3Q9JLV5 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cul3Q9JLV5 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cul3Q9JLV5 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cul3Q9JLV5 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cul3Q9JLV5 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cul3Q9JLV5 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cul3Q9JLV5 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cul3Q9JLV5 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cul3Q9JLV5 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cul3Q9JLV5 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cul3Q9JLV5 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cul3Q9JLV5 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cul3Q9JLV5 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cul3Q9JLV5 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Cul3Q9JLV5 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cul3Q9JLV5 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cul3Q9JLV5 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cul3Q9JLV5 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cul3Q9JLV5 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cul3Q9JLV5 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cul3Q9JLV5 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cul3Q9JLV5 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cul3Q9JLV5 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cul3Q9JLV5 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cul3Q9JLV5 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Cul3Q9JLV5 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cul3Q9JLV5 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cul3Q9JLV5 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cul3Q9JLV5 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cul3Q9JLV5 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cul3Q9JLV5 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cul3Q9JLV5 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cul3Q9JLV5 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cul3Q9JLV5 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cul3Q9JLV5 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cul3Q9JLV5 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cul3Q9JLV5 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cul3Q9JLV5 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cul3Q9JLV5 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cul3Q9JLV5 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cul3Q9JLV5 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cul3Q9JLV5 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Cul3Q9JLV5 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cul3Q9JLV5 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cul3Q9JLV5 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Cul3Q9JLV5 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Cul3Q9JLV5 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cul3Q9JLV5 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cul3Q9JLV5 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cul3Q9JLV5 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cul3Q9JLV5 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cul3Q9JLV5 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cul3Q9JLV5 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cul3Q9JLV5 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cul3Q9JLV5 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Cul3Q9JLV5 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cul3Q9JLV5 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cul3Q9JLV5 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cul3Q9JLV5 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cul3Q9JLV5 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cul3Q9JLV5 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cul3Q9JLV5 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cul3Q9JLV5 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cul3Q9JLV5 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cul3Q9JLV5 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cul3Q9JLV5 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cul3Q9JLV5 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cul3Q9JLV5 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cul3Q9JLV5 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cul3Q9JLV5 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cul3Q9JLV5 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cul3Q9JLV5 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cul3Q9JLV5 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cul3Q9JLV5 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Cul3Q9JLV5 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cul3Q9JLV5 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cul3Q9JLV5 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cul3Q9JLV5 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cul3Q9JLV5 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cul3Q9JLV5 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cul3Q9JLV5 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cul3Q9JLV5 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cul3Q9JLV5 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cul3Q9JLV5 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cul3Q9JLV5 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cul3Q9JLV5 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cul3Q9JLV5 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cul3Q9JLV5 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cul3Q9JLV5 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cul3Q9JLV5 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cul3Q9JLV5 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cul3Q9JLV5 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cul3Q9JLV5 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cul3Q9JLV5 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Cul3Q9JLV5 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms