Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLL3

Tnfrsf19, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 19, mousemouse

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Length 416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf19Q9JLL3 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnfrsf19Q9JLL3 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnfrsf19Q9JLL3 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnfrsf19Q9JLL3 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnfrsf19Q9JLL3 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tnfrsf19Q9JLL3 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tnfrsf19Q9JLL3 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tnfrsf19Q9JLL3 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tnfrsf19Q9JLL3 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tnfrsf19Q9JLL3 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tnfrsf19Q9JLL3 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tnfrsf19Q9JLL3 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tnfrsf19Q9JLL3 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfrsf19Q9JLL3 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfrsf19Q9JLL3 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfrsf19Q9JLL3 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfrsf19Q9JLL3 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfrsf19Q9JLL3 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfrsf19Q9JLL3 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfrsf19Q9JLL3 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfrsf19Q9JLL3 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfrsf19Q9JLL3 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfrsf19Q9JLL3 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfrsf19Q9JLL3 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfrsf19Q9JLL3 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfrsf19Q9JLL3 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfrsf19Q9JLL3 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfrsf19Q9JLL3 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfrsf19Q9JLL3 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfrsf19Q9JLL3 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfrsf19Q9JLL3 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfrsf19Q9JLL3 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfrsf19Q9JLL3 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfrsf19Q9JLL3 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfrsf19Q9JLL3 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfrsf19Q9JLL3 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfrsf19Q9JLL3 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfrsf19Q9JLL3 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfrsf19Q9JLL3 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnfrsf19Q9JLL3 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnfrsf19Q9JLL3 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnfrsf19Q9JLL3 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnfrsf19Q9JLL3 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnfrsf19Q9JLL3 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnfrsf19Q9JLL3 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnfrsf19Q9JLL3 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnfrsf19Q9JLL3 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnfrsf19Q9JLL3 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnfrsf19Q9JLL3 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnfrsf19Q9JLL3 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnfrsf19Q9JLL3 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnfrsf19Q9JLL3 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnfrsf19Q9JLL3 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnfrsf19Q9JLL3 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfrsf19Q9JLL3 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfrsf19Q9JLL3 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfrsf19Q9JLL3 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfrsf19Q9JLL3 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfrsf19Q9JLL3 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfrsf19Q9JLL3 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfrsf19Q9JLL3 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfrsf19Q9JLL3 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfrsf19Q9JLL3 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfrsf19Q9JLL3 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfrsf19Q9JLL3 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfrsf19Q9JLL3 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfrsf19Q9JLL3 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfrsf19Q9JLL3 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfrsf19Q9JLL3 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfrsf19Q9JLL3 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfrsf19Q9JLL3 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfrsf19Q9JLL3 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfrsf19Q9JLL3 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfrsf19Q9JLL3 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfrsf19Q9JLL3 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfrsf19Q9JLL3 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfrsf19Q9JLL3 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfrsf19Q9JLL3 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfrsf19Q9JLL3 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfrsf19Q9JLL3 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfrsf19Q9JLL3 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfrsf19Q9JLL3 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfrsf19Q9JLL3 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfrsf19Q9JLL3 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfrsf19Q9JLL3 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfrsf19Q9JLL3 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfrsf19Q9JLL3 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfrsf19Q9JLL3 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms