Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLK4

Cabp2, Calcium-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cabp2Q9JLK4 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cabp2Q9JLK4 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cabp2Q9JLK4 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cabp2Q9JLK4 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cabp2Q9JLK4 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cabp2Q9JLK4 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cabp2Q9JLK4 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Cabp2Q9JLK4 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cabp2Q9JLK4 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cabp2Q9JLK4 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cabp2Q9JLK4 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cabp2Q9JLK4 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cabp2Q9JLK4 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cabp2Q9JLK4 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Cabp2Q9JLK4 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cabp2Q9JLK4 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cabp2Q9JLK4 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cabp2Q9JLK4 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cabp2Q9JLK4 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cabp2Q9JLK4 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cabp2Q9JLK4 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cabp2Q9JLK4 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cabp2Q9JLK4 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cabp2Q9JLK4 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cabp2Q9JLK4 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cabp2Q9JLK4 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cabp2Q9JLK4 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cabp2Q9JLK4 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cabp2Q9JLK4 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cabp2Q9JLK4 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Cabp2Q9JLK4 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cabp2Q9JLK4 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cabp2Q9JLK4 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cabp2Q9JLK4 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cabp2Q9JLK4 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cabp2Q9JLK4 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cabp2Q9JLK4 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cabp2Q9JLK4 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cabp2Q9JLK4 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cabp2Q9JLK4 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cabp2Q9JLK4 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cabp2Q9JLK4 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Cabp2Q9JLK4 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Cabp2Q9JLK4 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Cabp2Q9JLK4 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cabp2Q9JLK4 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cabp2Q9JLK4 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cabp2Q9JLK4 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Cabp2Q9JLK4 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cabp2Q9JLK4 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Cabp2Q9JLK4 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cabp2Q9JLK4 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Cabp2Q9JLK4 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cabp2Q9JLK4 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cabp2Q9JLK4 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cabp2Q9JLK4 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cabp2Q9JLK4 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cabp2Q9JLK4 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cabp2Q9JLK4 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Cabp2Q9JLK4 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cabp2Q9JLK4 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cabp2Q9JLK4 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cabp2Q9JLK4 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cabp2Q9JLK4 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cabp2Q9JLK4 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cabp2Q9JLK4 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cabp2Q9JLK4 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cabp2Q9JLK4 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cabp2Q9JLK4 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cabp2Q9JLK4 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Cabp2Q9JLK4 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cabp2Q9JLK4 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cabp2Q9JLK4 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cabp2Q9JLK4 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cabp2Q9JLK4 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cabp2Q9JLK4 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cabp2Q9JLK4 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cabp2Q9JLK4 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Cabp2Q9JLK4 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cabp2Q9JLK4 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cabp2Q9JLK4 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cabp2Q9JLK4 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cabp2Q9JLK4 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Cabp2Q9JLK4 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cabp2Q9JLK4 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cabp2Q9JLK4 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cabp2Q9JLK4 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cabp2Q9JLK4 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cabp2Q9JLK4 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cabp2Q9JLK4 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cabp2Q9JLK4 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cabp2Q9JLK4 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cabp2Q9JLK4 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cabp2Q9JLK4 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cabp2Q9JLK4 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cabp2Q9JLK4 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cabp2Q9JLK4 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cabp2Q9JLK4 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cabp2Q9JLK4 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cabp2Q9JLK4 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms