Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLJ2

Aldh9a1, 4-trimethylaminobutyraldehyde dehydrogenase, mousemouse

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aldh9a1Q9JLJ2 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Aldh9a1Q9JLJ2 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Aldh9a1Q9JLJ2 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Aldh9a1Q9JLJ2 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Aldh9a1Q9JLJ2 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Aldh9a1Q9JLJ2 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Aldh9a1Q9JLJ2 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Aldh9a1Q9JLJ2 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Aldh9a1Q9JLJ2 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Aldh9a1Q9JLJ2 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Aldh9a1Q9JLJ2 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Aldh9a1Q9JLJ2 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Aldh9a1Q9JLJ2 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Aldh9a1Q9JLJ2 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Aldh9a1Q9JLJ2 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Aldh9a1Q9JLJ2 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Aldh9a1Q9JLJ2 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Aldh9a1Q9JLJ2 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Aldh9a1Q9JLJ2 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Aldh9a1Q9JLJ2 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Aldh9a1Q9JLJ2 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Aldh9a1Q9JLJ2 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Aldh9a1Q9JLJ2 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Aldh9a1Q9JLJ2 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Aldh9a1Q9JLJ2 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Aldh9a1Q9JLJ2 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Aldh9a1Q9JLJ2 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Aldh9a1Q9JLJ2 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Aldh9a1Q9JLJ2 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Aldh9a1Q9JLJ2 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Aldh9a1Q9JLJ2 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Aldh9a1Q9JLJ2 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Aldh9a1Q9JLJ2 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Aldh9a1Q9JLJ2 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Aldh9a1Q9JLJ2 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Aldh9a1Q9JLJ2 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Aldh9a1Q9JLJ2 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Aldh9a1Q9JLJ2 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Aldh9a1Q9JLJ2 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Aldh9a1Q9JLJ2 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Aldh9a1Q9JLJ2 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Aldh9a1Q9JLJ2 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Aldh9a1Q9JLJ2 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Aldh9a1Q9JLJ2 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Aldh9a1Q9JLJ2 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Aldh9a1Q9JLJ2 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Aldh9a1Q9JLJ2 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Aldh9a1Q9JLJ2 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Aldh9a1Q9JLJ2 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Aldh9a1Q9JLJ2 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Aldh9a1Q9JLJ2 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Aldh9a1Q9JLJ2 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Aldh9a1Q9JLJ2 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Aldh9a1Q9JLJ2 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Aldh9a1Q9JLJ2 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Aldh9a1Q9JLJ2 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Aldh9a1Q9JLJ2 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Aldh9a1Q9JLJ2 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Aldh9a1Q9JLJ2 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Aldh9a1Q9JLJ2 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Aldh9a1Q9JLJ2 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Aldh9a1Q9JLJ2 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Aldh9a1Q9JLJ2 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Aldh9a1Q9JLJ2 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Aldh9a1Q9JLJ2 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Aldh9a1Q9JLJ2 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Aldh9a1Q9JLJ2 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Aldh9a1Q9JLJ2 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Aldh9a1Q9JLJ2 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Aldh9a1Q9JLJ2 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Aldh9a1Q9JLJ2 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Aldh9a1Q9JLJ2 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Aldh9a1Q9JLJ2 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Aldh9a1Q9JLJ2 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Aldh9a1Q9JLJ2 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Aldh9a1Q9JLJ2 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Aldh9a1Q9JLJ2 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Aldh9a1Q9JLJ2 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Aldh9a1Q9JLJ2 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Aldh9a1Q9JLJ2 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Aldh9a1Q9JLJ2 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Aldh9a1Q9JLJ2 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Aldh9a1Q9JLJ2 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Aldh9a1Q9JLJ2 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Aldh9a1Q9JLJ2 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Aldh9a1Q9JLJ2 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Aldh9a1Q9JLJ2 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Aldh9a1Q9JLJ2 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Aldh9a1Q9JLJ2 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Aldh9a1Q9JLJ2 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Aldh9a1Q9JLJ2 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Aldh9a1Q9JLJ2 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Aldh9a1Q9JLJ2 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Aldh9a1Q9JLJ2 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Aldh9a1Q9JLJ2 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Aldh9a1Q9JLJ2 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Aldh9a1Q9JLJ2 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Aldh9a1Q9JLJ2 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Aldh9a1Q9JLJ2 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Aldh9a1Q9JLJ2 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms