Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF6

Tgm1, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase K, mousemouse

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Length 815 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm1Q9JLF6 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tgm1Q9JLF6 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tgm1Q9JLF6 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tgm1Q9JLF6 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tgm1Q9JLF6 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tgm1Q9JLF6 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tgm1Q9JLF6 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tgm1Q9JLF6 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tgm1Q9JLF6 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tgm1Q9JLF6 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tgm1Q9JLF6 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tgm1Q9JLF6 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tgm1Q9JLF6 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tgm1Q9JLF6 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Tgm1Q9JLF6 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Tgm1Q9JLF6 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tgm1Q9JLF6 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tgm1Q9JLF6 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tgm1Q9JLF6 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tgm1Q9JLF6 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Tgm1Q9JLF6 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tgm1Q9JLF6 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tgm1Q9JLF6 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tgm1Q9JLF6 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tgm1Q9JLF6 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tgm1Q9JLF6 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tgm1Q9JLF6 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tgm1Q9JLF6 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tgm1Q9JLF6 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tgm1Q9JLF6 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tgm1Q9JLF6 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tgm1Q9JLF6 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tgm1Q9JLF6 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tgm1Q9JLF6 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tgm1Q9JLF6 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tgm1Q9JLF6 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tgm1Q9JLF6 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tgm1Q9JLF6 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tgm1Q9JLF6 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tgm1Q9JLF6 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tgm1Q9JLF6 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tgm1Q9JLF6 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tgm1Q9JLF6 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tgm1Q9JLF6 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tgm1Q9JLF6 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tgm1Q9JLF6 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tgm1Q9JLF6 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Tgm1Q9JLF6 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tgm1Q9JLF6 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tgm1Q9JLF6 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tgm1Q9JLF6 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tgm1Q9JLF6 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tgm1Q9JLF6 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tgm1Q9JLF6 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Tgm1Q9JLF6 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tgm1Q9JLF6 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tgm1Q9JLF6 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tgm1Q9JLF6 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tgm1Q9JLF6 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Tgm1Q9JLF6 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tgm1Q9JLF6 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tgm1Q9JLF6 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tgm1Q9JLF6 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tgm1Q9JLF6 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tgm1Q9JLF6 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tgm1Q9JLF6 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tgm1Q9JLF6 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Tgm1Q9JLF6 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tgm1Q9JLF6 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tgm1Q9JLF6 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tgm1Q9JLF6 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tgm1Q9JLF6 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tgm1Q9JLF6 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tgm1Q9JLF6 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tgm1Q9JLF6 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tgm1Q9JLF6 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tgm1Q9JLF6 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tgm1Q9JLF6 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tgm1Q9JLF6 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tgm1Q9JLF6 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Tgm1Q9JLF6 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tgm1Q9JLF6 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Tgm1Q9JLF6 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tgm1Q9JLF6 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tgm1Q9JLF6 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tgm1Q9JLF6 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tgm1Q9JLF6 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tgm1Q9JLF6 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tgm1Q9JLF6 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tgm1Q9JLF6 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tgm1Q9JLF6 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tgm1Q9JLF6 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tgm1Q9JLF6 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tgm1Q9JLF6 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tgm1Q9JLF6 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tgm1Q9JLF6 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tgm1Q9JLF6 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tgm1Q9JLF6 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tgm1Q9JLF6 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tgm1Q9JLF6 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms