Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLC6

Tef, Thyrotroph embryonic factor, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TefQ9JLC6 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TefQ9JLC6 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TefQ9JLC6 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TefQ9JLC6 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TefQ9JLC6 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TefQ9JLC6 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TefQ9JLC6 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TefQ9JLC6 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TefQ9JLC6 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TefQ9JLC6 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TefQ9JLC6 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TefQ9JLC6 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TefQ9JLC6 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TefQ9JLC6 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TefQ9JLC6 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TefQ9JLC6 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TefQ9JLC6 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TefQ9JLC6 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TefQ9JLC6 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TefQ9JLC6 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TefQ9JLC6 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TefQ9JLC6 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TefQ9JLC6 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TefQ9JLC6 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TefQ9JLC6 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TefQ9JLC6 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TefQ9JLC6 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TefQ9JLC6 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TefQ9JLC6 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TefQ9JLC6 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TefQ9JLC6 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TefQ9JLC6 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TefQ9JLC6 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TefQ9JLC6 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TefQ9JLC6 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TefQ9JLC6 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TefQ9JLC6 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TefQ9JLC6 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TefQ9JLC6 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TefQ9JLC6 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TefQ9JLC6 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TefQ9JLC6 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TefQ9JLC6 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TefQ9JLC6 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TefQ9JLC6 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TefQ9JLC6 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TefQ9JLC6 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TefQ9JLC6 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TefQ9JLC6 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TefQ9JLC6 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TefQ9JLC6 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TefQ9JLC6 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TefQ9JLC6 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TefQ9JLC6 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TefQ9JLC6 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TefQ9JLC6 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TefQ9JLC6 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TefQ9JLC6 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TefQ9JLC6 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TefQ9JLC6 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TefQ9JLC6 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TefQ9JLC6 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TefQ9JLC6 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TefQ9JLC6 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TefQ9JLC6 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TefQ9JLC6 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TefQ9JLC6 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TefQ9JLC6 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TefQ9JLC6 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TefQ9JLC6 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TefQ9JLC6 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TefQ9JLC6 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TefQ9JLC6 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TefQ9JLC6 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TefQ9JLC6 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TefQ9JLC6 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TefQ9JLC6 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TefQ9JLC6 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TefQ9JLC6 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TefQ9JLC6 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TefQ9JLC6 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TefQ9JLC6 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TefQ9JLC6 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TefQ9JLC6 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TefQ9JLC6 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TefQ9JLC6 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TefQ9JLC6 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TefQ9JLC6 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TefQ9JLC6 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TefQ9JLC6 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TefQ9JLC6 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TefQ9JLC6 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TefQ9JLC6 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TefQ9JLC6 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TefQ9JLC6 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TefQ9JLC6 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TefQ9JLC6 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TefQ9JLC6 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TefQ9JLC6 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TefQ9JLC6 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms