Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKX8

Upk3a, Uroplakin-3a, mousemouse

Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upk3aQ9JKX8 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Upk3aQ9JKX8 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Upk3aQ9JKX8 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Upk3aQ9JKX8 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Upk3aQ9JKX8 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Upk3aQ9JKX8 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Upk3aQ9JKX8 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Upk3aQ9JKX8 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Upk3aQ9JKX8 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Upk3aQ9JKX8 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Upk3aQ9JKX8 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Upk3aQ9JKX8 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Upk3aQ9JKX8 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Upk3aQ9JKX8 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Upk3aQ9JKX8 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Upk3aQ9JKX8 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Upk3aQ9JKX8 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Upk3aQ9JKX8 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Upk3aQ9JKX8 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Upk3aQ9JKX8 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Upk3aQ9JKX8 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Upk3aQ9JKX8 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Upk3aQ9JKX8 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Upk3aQ9JKX8 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Upk3aQ9JKX8 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Upk3aQ9JKX8 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Upk3aQ9JKX8 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Upk3aQ9JKX8 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Upk3aQ9JKX8 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Upk3aQ9JKX8 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Upk3aQ9JKX8 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Upk3aQ9JKX8 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Upk3aQ9JKX8 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Upk3aQ9JKX8 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Upk3aQ9JKX8 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Upk3aQ9JKX8 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Upk3aQ9JKX8 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Upk3aQ9JKX8 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Upk3aQ9JKX8 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Upk3aQ9JKX8 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Upk3aQ9JKX8 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Upk3aQ9JKX8 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Upk3aQ9JKX8 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Upk3aQ9JKX8 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Upk3aQ9JKX8 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Upk3aQ9JKX8 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Upk3aQ9JKX8 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Upk3aQ9JKX8 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Upk3aQ9JKX8 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Upk3aQ9JKX8 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Upk3aQ9JKX8 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Upk3aQ9JKX8 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Upk3aQ9JKX8 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Upk3aQ9JKX8 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Upk3aQ9JKX8 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Upk3aQ9JKX8 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Upk3aQ9JKX8 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Upk3aQ9JKX8 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Upk3aQ9JKX8 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Upk3aQ9JKX8 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Upk3aQ9JKX8 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Upk3aQ9JKX8 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Upk3aQ9JKX8 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Upk3aQ9JKX8 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Upk3aQ9JKX8 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Upk3aQ9JKX8 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Upk3aQ9JKX8 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Upk3aQ9JKX8 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Upk3aQ9JKX8 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Upk3aQ9JKX8 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Upk3aQ9JKX8 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Upk3aQ9JKX8 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Upk3aQ9JKX8 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Upk3aQ9JKX8 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Upk3aQ9JKX8 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Upk3aQ9JKX8 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Upk3aQ9JKX8 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Upk3aQ9JKX8 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Upk3aQ9JKX8 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Upk3aQ9JKX8 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Upk3aQ9JKX8 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Upk3aQ9JKX8 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Upk3aQ9JKX8 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Upk3aQ9JKX8 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Upk3aQ9JKX8 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Upk3aQ9JKX8 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Upk3aQ9JKX8 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Upk3aQ9JKX8 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Upk3aQ9JKX8 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Upk3aQ9JKX8 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Upk3aQ9JKX8 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Upk3aQ9JKX8 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Upk3aQ9JKX8 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Upk3aQ9JKX8 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Upk3aQ9JKX8 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Upk3aQ9JKX8 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Upk3aQ9JKX8 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Upk3aQ9JKX8 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Upk3aQ9JKX8 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Upk3aQ9JKX8 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms