Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKW0

Arl6ip1, ADP-ribosylation factor-like protein 6-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arl6ip1Q9JKW0 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Arl6ip1Q9JKW0 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Arl6ip1Q9JKW0 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Arl6ip1Q9JKW0 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Arl6ip1Q9JKW0 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Arl6ip1Q9JKW0 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Arl6ip1Q9JKW0 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Arl6ip1Q9JKW0 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Arl6ip1Q9JKW0 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Arl6ip1Q9JKW0 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Arl6ip1Q9JKW0 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Arl6ip1Q9JKW0 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Arl6ip1Q9JKW0 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Arl6ip1Q9JKW0 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Arl6ip1Q9JKW0 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Arl6ip1Q9JKW0 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Arl6ip1Q9JKW0 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Arl6ip1Q9JKW0 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Arl6ip1Q9JKW0 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Arl6ip1Q9JKW0 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Arl6ip1Q9JKW0 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Arl6ip1Q9JKW0 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Arl6ip1Q9JKW0 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Arl6ip1Q9JKW0 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Arl6ip1Q9JKW0 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Arl6ip1Q9JKW0 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Arl6ip1Q9JKW0 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Arl6ip1Q9JKW0 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Arl6ip1Q9JKW0 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Arl6ip1Q9JKW0 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Arl6ip1Q9JKW0 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Arl6ip1Q9JKW0 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Arl6ip1Q9JKW0 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Arl6ip1Q9JKW0 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Arl6ip1Q9JKW0 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Arl6ip1Q9JKW0 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Arl6ip1Q9JKW0 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Arl6ip1Q9JKW0 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Arl6ip1Q9JKW0 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Arl6ip1Q9JKW0 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Arl6ip1Q9JKW0 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Arl6ip1Q9JKW0 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Arl6ip1Q9JKW0 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Arl6ip1Q9JKW0 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Arl6ip1Q9JKW0 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Arl6ip1Q9JKW0 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Arl6ip1Q9JKW0 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Arl6ip1Q9JKW0 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Arl6ip1Q9JKW0 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Arl6ip1Q9JKW0 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Arl6ip1Q9JKW0 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Arl6ip1Q9JKW0 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Arl6ip1Q9JKW0 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Arl6ip1Q9JKW0 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Arl6ip1Q9JKW0 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Arl6ip1Q9JKW0 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Arl6ip1Q9JKW0 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Arl6ip1Q9JKW0 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Arl6ip1Q9JKW0 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Arl6ip1Q9JKW0 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Arl6ip1Q9JKW0 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Arl6ip1Q9JKW0 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Arl6ip1Q9JKW0 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Arl6ip1Q9JKW0 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Arl6ip1Q9JKW0 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Arl6ip1Q9JKW0 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Arl6ip1Q9JKW0 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Arl6ip1Q9JKW0 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Arl6ip1Q9JKW0 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Arl6ip1Q9JKW0 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Arl6ip1Q9JKW0 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Arl6ip1Q9JKW0 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Arl6ip1Q9JKW0 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Arl6ip1Q9JKW0 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Arl6ip1Q9JKW0 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Arl6ip1Q9JKW0 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Arl6ip1Q9JKW0 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Arl6ip1Q9JKW0 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Arl6ip1Q9JKW0 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Arl6ip1Q9JKW0 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Arl6ip1Q9JKW0 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Arl6ip1Q9JKW0 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Arl6ip1Q9JKW0 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Arl6ip1Q9JKW0 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Arl6ip1Q9JKW0 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Arl6ip1Q9JKW0 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Arl6ip1Q9JKW0 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Arl6ip1Q9JKW0 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Arl6ip1Q9JKW0 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Arl6ip1Q9JKW0 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Arl6ip1Q9JKW0 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Arl6ip1Q9JKW0 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Arl6ip1Q9JKW0 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Arl6ip1Q9JKW0 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Arl6ip1Q9JKW0 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Arl6ip1Q9JKW0 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Arl6ip1Q9JKW0 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Arl6ip1Q9JKW0 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Arl6ip1Q9JKW0 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Arl6ip1Q9JKW0 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms