Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKV5

Scamp4, Secretory carrier-associated membrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp4Q9JKV5 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Scamp4Q9JKV5 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Scamp4Q9JKV5 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Scamp4Q9JKV5 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Scamp4Q9JKV5 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Scamp4Q9JKV5 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Scamp4Q9JKV5 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Scamp4Q9JKV5 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Scamp4Q9JKV5 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Scamp4Q9JKV5 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Scamp4Q9JKV5 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Scamp4Q9JKV5 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Scamp4Q9JKV5 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Scamp4Q9JKV5 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Scamp4Q9JKV5 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Scamp4Q9JKV5 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Scamp4Q9JKV5 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Scamp4Q9JKV5 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Scamp4Q9JKV5 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Scamp4Q9JKV5 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Scamp4Q9JKV5 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Scamp4Q9JKV5 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Scamp4Q9JKV5 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Scamp4Q9JKV5 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Scamp4Q9JKV5 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Scamp4Q9JKV5 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Scamp4Q9JKV5 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Scamp4Q9JKV5 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Scamp4Q9JKV5 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Scamp4Q9JKV5 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Scamp4Q9JKV5 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Scamp4Q9JKV5 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Scamp4Q9JKV5 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Scamp4Q9JKV5 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Scamp4Q9JKV5 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Scamp4Q9JKV5 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Scamp4Q9JKV5 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Scamp4Q9JKV5 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Scamp4Q9JKV5 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Scamp4Q9JKV5 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Scamp4Q9JKV5 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Scamp4Q9JKV5 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Scamp4Q9JKV5 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Scamp4Q9JKV5 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Scamp4Q9JKV5 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Scamp4Q9JKV5 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Scamp4Q9JKV5 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Scamp4Q9JKV5 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Scamp4Q9JKV5 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Scamp4Q9JKV5 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Scamp4Q9JKV5 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Scamp4Q9JKV5 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Scamp4Q9JKV5 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Scamp4Q9JKV5 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Scamp4Q9JKV5 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Scamp4Q9JKV5 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Scamp4Q9JKV5 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Scamp4Q9JKV5 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Scamp4Q9JKV5 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Scamp4Q9JKV5 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Scamp4Q9JKV5 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Scamp4Q9JKV5 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Scamp4Q9JKV5 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Scamp4Q9JKV5 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Scamp4Q9JKV5 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Scamp4Q9JKV5 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Scamp4Q9JKV5 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Scamp4Q9JKV5 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Scamp4Q9JKV5 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Scamp4Q9JKV5 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Scamp4Q9JKV5 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Scamp4Q9JKV5 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Scamp4Q9JKV5 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Scamp4Q9JKV5 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Scamp4Q9JKV5 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Scamp4Q9JKV5 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Scamp4Q9JKV5 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Scamp4Q9JKV5 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Scamp4Q9JKV5 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Scamp4Q9JKV5 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Scamp4Q9JKV5 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Scamp4Q9JKV5 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Scamp4Q9JKV5 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Scamp4Q9JKV5 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Scamp4Q9JKV5 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Scamp4Q9JKV5 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Scamp4Q9JKV5 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Scamp4Q9JKV5 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Scamp4Q9JKV5 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Scamp4Q9JKV5 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Scamp4Q9JKV5 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Scamp4Q9JKV5 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Scamp4Q9JKV5 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Scamp4Q9JKV5 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Scamp4Q9JKV5 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Scamp4Q9JKV5 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Scamp4Q9JKV5 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Scamp4Q9JKV5 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Scamp4Q9JKV5 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Scamp4Q9JKV5 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms