Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKJ9

Cyp39a1, 24-hydroxycholesterol 7-alpha-hydroxylase, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp39a1Q9JKJ9 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cyp39a1Q9JKJ9 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cyp39a1Q9JKJ9 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cyp39a1Q9JKJ9 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Cyp39a1Q9JKJ9 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cyp39a1Q9JKJ9 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cyp39a1Q9JKJ9 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cyp39a1Q9JKJ9 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cyp39a1Q9JKJ9 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cyp39a1Q9JKJ9 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cyp39a1Q9JKJ9 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cyp39a1Q9JKJ9 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cyp39a1Q9JKJ9 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cyp39a1Q9JKJ9 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cyp39a1Q9JKJ9 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cyp39a1Q9JKJ9 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cyp39a1Q9JKJ9 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cyp39a1Q9JKJ9 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Cyp39a1Q9JKJ9 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cyp39a1Q9JKJ9 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cyp39a1Q9JKJ9 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cyp39a1Q9JKJ9 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cyp39a1Q9JKJ9 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cyp39a1Q9JKJ9 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cyp39a1Q9JKJ9 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Cyp39a1Q9JKJ9 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cyp39a1Q9JKJ9 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cyp39a1Q9JKJ9 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cyp39a1Q9JKJ9 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cyp39a1Q9JKJ9 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cyp39a1Q9JKJ9 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cyp39a1Q9JKJ9 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cyp39a1Q9JKJ9 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cyp39a1Q9JKJ9 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cyp39a1Q9JKJ9 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cyp39a1Q9JKJ9 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cyp39a1Q9JKJ9 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Cyp39a1Q9JKJ9 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cyp39a1Q9JKJ9 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cyp39a1Q9JKJ9 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cyp39a1Q9JKJ9 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cyp39a1Q9JKJ9 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cyp39a1Q9JKJ9 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cyp39a1Q9JKJ9 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cyp39a1Q9JKJ9 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cyp39a1Q9JKJ9 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Cyp39a1Q9JKJ9 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cyp39a1Q9JKJ9 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cyp39a1Q9JKJ9 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Cyp39a1Q9JKJ9 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cyp39a1Q9JKJ9 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cyp39a1Q9JKJ9 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cyp39a1Q9JKJ9 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cyp39a1Q9JKJ9 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cyp39a1Q9JKJ9 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cyp39a1Q9JKJ9 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cyp39a1Q9JKJ9 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cyp39a1Q9JKJ9 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cyp39a1Q9JKJ9 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cyp39a1Q9JKJ9 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cyp39a1Q9JKJ9 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cyp39a1Q9JKJ9 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cyp39a1Q9JKJ9 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cyp39a1Q9JKJ9 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Cyp39a1Q9JKJ9 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cyp39a1Q9JKJ9 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cyp39a1Q9JKJ9 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
Cyp39a1Q9JKJ9 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cyp39a1Q9JKJ9 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Cyp39a1Q9JKJ9 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Cyp39a1Q9JKJ9 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cyp39a1Q9JKJ9 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cyp39a1Q9JKJ9 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cyp39a1Q9JKJ9 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Cyp39a1Q9JKJ9 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cyp39a1Q9JKJ9 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cyp39a1Q9JKJ9 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cyp39a1Q9JKJ9 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cyp39a1Q9JKJ9 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cyp39a1Q9JKJ9 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cyp39a1Q9JKJ9 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cyp39a1Q9JKJ9 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Cyp39a1Q9JKJ9 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cyp39a1Q9JKJ9 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cyp39a1Q9JKJ9 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cyp39a1Q9JKJ9 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cyp39a1Q9JKJ9 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cyp39a1Q9JKJ9 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cyp39a1Q9JKJ9 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cyp39a1Q9JKJ9 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63 ms