Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJW6

Alyref2, Aly/REF export factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alyref2Q9JJW6 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Alyref2Q9JJW6 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Alyref2Q9JJW6 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Alyref2Q9JJW6 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Alyref2Q9JJW6 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Alyref2Q9JJW6 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Alyref2Q9JJW6 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Alyref2Q9JJW6 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Alyref2Q9JJW6 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Alyref2Q9JJW6 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Alyref2Q9JJW6 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Alyref2Q9JJW6 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Alyref2Q9JJW6 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Alyref2Q9JJW6 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Alyref2Q9JJW6 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Alyref2Q9JJW6 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Alyref2Q9JJW6 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Alyref2Q9JJW6 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Alyref2Q9JJW6 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Alyref2Q9JJW6 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Alyref2Q9JJW6 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Alyref2Q9JJW6 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Alyref2Q9JJW6 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Alyref2Q9JJW6 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Alyref2Q9JJW6 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Alyref2Q9JJW6 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Alyref2Q9JJW6 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Alyref2Q9JJW6 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Alyref2Q9JJW6 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Alyref2Q9JJW6 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Alyref2Q9JJW6 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Alyref2Q9JJW6 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Alyref2Q9JJW6 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Alyref2Q9JJW6 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Alyref2Q9JJW6 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Alyref2Q9JJW6 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Alyref2Q9JJW6 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Alyref2Q9JJW6 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Alyref2Q9JJW6 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Alyref2Q9JJW6 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Alyref2Q9JJW6 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Alyref2Q9JJW6 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Alyref2Q9JJW6 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Alyref2Q9JJW6 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Alyref2Q9JJW6 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Alyref2Q9JJW6 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Alyref2Q9JJW6 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Alyref2Q9JJW6 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Alyref2Q9JJW6 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Alyref2Q9JJW6 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Alyref2Q9JJW6 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Alyref2Q9JJW6 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Alyref2Q9JJW6 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Alyref2Q9JJW6 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Alyref2Q9JJW6 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Alyref2Q9JJW6 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Alyref2Q9JJW6 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Alyref2Q9JJW6 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Alyref2Q9JJW6 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Alyref2Q9JJW6 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Alyref2Q9JJW6 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Alyref2Q9JJW6 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Alyref2Q9JJW6 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Alyref2Q9JJW6 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Alyref2Q9JJW6 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Alyref2Q9JJW6 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Alyref2Q9JJW6 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Alyref2Q9JJW6 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Alyref2Q9JJW6 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Alyref2Q9JJW6 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Alyref2Q9JJW6 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Alyref2Q9JJW6 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Alyref2Q9JJW6 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Alyref2Q9JJW6 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Alyref2Q9JJW6 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Alyref2Q9JJW6 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Alyref2Q9JJW6 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Alyref2Q9JJW6 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Alyref2Q9JJW6 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Alyref2Q9JJW6 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Alyref2Q9JJW6 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Alyref2Q9JJW6 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Alyref2Q9JJW6 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Alyref2Q9JJW6 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Alyref2Q9JJW6 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Alyref2Q9JJW6 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Alyref2Q9JJW6 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Alyref2Q9JJW6 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Alyref2Q9JJW6 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Alyref2Q9JJW6 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Alyref2Q9JJW6 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Alyref2Q9JJW6 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Alyref2Q9JJW6 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Alyref2Q9JJW6 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Alyref2Q9JJW6 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Alyref2Q9JJW6 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Alyref2Q9JJW6 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Alyref2Q9JJW6 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Alyref2Q9JJW6 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Alyref2Q9JJW6 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms