Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIS8

Slc12a4, Solute carrier family 12 member 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,085 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc12a4Q9JIS8 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slc12a4Q9JIS8 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slc12a4Q9JIS8 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slc12a4Q9JIS8 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slc12a4Q9JIS8 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slc12a4Q9JIS8 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slc12a4Q9JIS8 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slc12a4Q9JIS8 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slc12a4Q9JIS8 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slc12a4Q9JIS8 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slc12a4Q9JIS8 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slc12a4Q9JIS8 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slc12a4Q9JIS8 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slc12a4Q9JIS8 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slc12a4Q9JIS8 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Slc12a4Q9JIS8 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slc12a4Q9JIS8 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slc12a4Q9JIS8 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slc12a4Q9JIS8 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slc12a4Q9JIS8 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slc12a4Q9JIS8 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slc12a4Q9JIS8 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slc12a4Q9JIS8 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slc12a4Q9JIS8 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slc12a4Q9JIS8 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slc12a4Q9JIS8 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slc12a4Q9JIS8 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slc12a4Q9JIS8 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slc12a4Q9JIS8 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slc12a4Q9JIS8 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slc12a4Q9JIS8 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slc12a4Q9JIS8 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slc12a4Q9JIS8 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slc12a4Q9JIS8 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slc12a4Q9JIS8 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slc12a4Q9JIS8 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slc12a4Q9JIS8 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slc12a4Q9JIS8 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slc12a4Q9JIS8 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slc12a4Q9JIS8 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slc12a4Q9JIS8 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slc12a4Q9JIS8 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slc12a4Q9JIS8 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slc12a4Q9JIS8 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slc12a4Q9JIS8 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slc12a4Q9JIS8 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slc12a4Q9JIS8 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slc12a4Q9JIS8 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slc12a4Q9JIS8 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slc12a4Q9JIS8 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slc12a4Q9JIS8 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slc12a4Q9JIS8 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slc12a4Q9JIS8 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slc12a4Q9JIS8 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slc12a4Q9JIS8 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slc12a4Q9JIS8 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Slc12a4Q9JIS8 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slc12a4Q9JIS8 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slc12a4Q9JIS8 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slc12a4Q9JIS8 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slc12a4Q9JIS8 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slc12a4Q9JIS8 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Slc12a4Q9JIS8 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Slc12a4Q9JIS8 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Slc12a4Q9JIS8 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Slc12a4Q9JIS8 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Slc12a4Q9JIS8 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Slc12a4Q9JIS8 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Slc12a4Q9JIS8 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Slc12a4Q9JIS8 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Slc12a4Q9JIS8 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Slc12a4Q9JIS8 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Slc12a4Q9JIS8 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Slc12a4Q9JIS8 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Slc12a4Q9JIS8 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Slc12a4Q9JIS8 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Slc12a4Q9JIS8 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Slc12a4Q9JIS8 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Slc12a4Q9JIS8 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Slc12a4Q9JIS8 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Slc12a4Q9JIS8 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Slc12a4Q9JIS8 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Slc12a4Q9JIS8 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Slc12a4Q9JIS8 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Slc12a4Q9JIS8 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Slc12a4Q9JIS8 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Slc12a4Q9JIS8 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Slc12a4Q9JIS8 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Slc12a4Q9JIS8 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Slc12a4Q9JIS8 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Slc12a4Q9JIS8 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Slc12a4Q9JIS8 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Slc12a4Q9JIS8 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Slc12a4Q9JIS8 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Slc12a4Q9JIS8 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Slc12a4Q9JIS8 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Slc12a4Q9JIS8 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Slc12a4Q9JIS8 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Slc12a4Q9JIS8 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
Slc12a4Q9JIS8 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms