Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIM3

Ercc6l2, DNA excision repair protein ERCC-6-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,537 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc6l2Q9JIM3 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ercc6l2Q9JIM3 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ercc6l2Q9JIM3 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ercc6l2Q9JIM3 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ercc6l2Q9JIM3 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ercc6l2Q9JIM3 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ercc6l2Q9JIM3 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ercc6l2Q9JIM3 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ercc6l2Q9JIM3 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ercc6l2Q9JIM3 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ercc6l2Q9JIM3 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ercc6l2Q9JIM3 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ercc6l2Q9JIM3 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ercc6l2Q9JIM3 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ercc6l2Q9JIM3 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ercc6l2Q9JIM3 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ercc6l2Q9JIM3 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ercc6l2Q9JIM3 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ercc6l2Q9JIM3 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ercc6l2Q9JIM3 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ercc6l2Q9JIM3 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ercc6l2Q9JIM3 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ercc6l2Q9JIM3 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ercc6l2Q9JIM3 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ercc6l2Q9JIM3 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ercc6l2Q9JIM3 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ercc6l2Q9JIM3 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ercc6l2Q9JIM3 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ercc6l2Q9JIM3 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
Ercc6l2Q9JIM3 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ercc6l2Q9JIM3 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ercc6l2Q9JIM3 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ercc6l2Q9JIM3 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ercc6l2Q9JIM3 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ercc6l2Q9JIM3 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Ercc6l2Q9JIM3 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ercc6l2Q9JIM3 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ercc6l2Q9JIM3 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ercc6l2Q9JIM3 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ercc6l2Q9JIM3 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ercc6l2Q9JIM3 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ercc6l2Q9JIM3 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Ercc6l2Q9JIM3 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ercc6l2Q9JIM3 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ercc6l2Q9JIM3 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ercc6l2Q9JIM3 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ercc6l2Q9JIM3 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ercc6l2Q9JIM3 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ercc6l2Q9JIM3 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Ercc6l2Q9JIM3 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ercc6l2Q9JIM3 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ercc6l2Q9JIM3 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ercc6l2Q9JIM3 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Ercc6l2Q9JIM3 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Ercc6l2Q9JIM3 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ercc6l2Q9JIM3 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ercc6l2Q9JIM3 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Ercc6l2Q9JIM3 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Ercc6l2Q9JIM3 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ercc6l2Q9JIM3 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ercc6l2Q9JIM3 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ercc6l2Q9JIM3 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ercc6l2Q9JIM3 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ercc6l2Q9JIM3 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ercc6l2Q9JIM3 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ercc6l2Q9JIM3 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ercc6l2Q9JIM3 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ercc6l2Q9JIM3 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ercc6l2Q9JIM3 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ercc6l2Q9JIM3 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ercc6l2Q9JIM3 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ercc6l2Q9JIM3 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ercc6l2Q9JIM3 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ercc6l2Q9JIM3 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ercc6l2Q9JIM3 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ercc6l2Q9JIM3 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Ercc6l2Q9JIM3 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Ercc6l2Q9JIM3 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Ercc6l2Q9JIM3 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Ercc6l2Q9JIM3 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Ercc6l2Q9JIM3 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ercc6l2Q9JIM3 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ercc6l2Q9JIM3 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ercc6l2Q9JIM3 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ercc6l2Q9JIM3 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ercc6l2Q9JIM3 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ercc6l2Q9JIM3 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ercc6l2Q9JIM3 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Ercc6l2Q9JIM3 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ercc6l2Q9JIM3 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ercc6l2Q9JIM3 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ercc6l2Q9JIM3 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ercc6l2Q9JIM3 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ercc6l2Q9JIM3 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ercc6l2Q9JIM3 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ercc6l2Q9JIM3 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ercc6l2Q9JIM3 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Ercc6l2Q9JIM3 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Ercc6l2Q9JIM3 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ercc6l2Q9JIM3 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms