Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHI7

Exosc9, Exosome complex component RRP45, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exosc9Q9JHI7 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Exosc9Q9JHI7 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Exosc9Q9JHI7 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Exosc9Q9JHI7 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Exosc9Q9JHI7 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Exosc9Q9JHI7 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Exosc9Q9JHI7 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Exosc9Q9JHI7 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Exosc9Q9JHI7 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Exosc9Q9JHI7 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Exosc9Q9JHI7 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Exosc9Q9JHI7 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Exosc9Q9JHI7 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Exosc9Q9JHI7 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Exosc9Q9JHI7 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Exosc9Q9JHI7 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Exosc9Q9JHI7 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Exosc9Q9JHI7 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Exosc9Q9JHI7 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Exosc9Q9JHI7 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Exosc9Q9JHI7 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Exosc9Q9JHI7 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Exosc9Q9JHI7 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Exosc9Q9JHI7 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Exosc9Q9JHI7 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Exosc9Q9JHI7 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Exosc9Q9JHI7 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Exosc9Q9JHI7 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Exosc9Q9JHI7 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Exosc9Q9JHI7 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Exosc9Q9JHI7 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Exosc9Q9JHI7 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Exosc9Q9JHI7 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Exosc9Q9JHI7 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Exosc9Q9JHI7 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Exosc9Q9JHI7 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Exosc9Q9JHI7 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Exosc9Q9JHI7 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Exosc9Q9JHI7 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Exosc9Q9JHI7 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Exosc9Q9JHI7 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Exosc9Q9JHI7 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Exosc9Q9JHI7 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Exosc9Q9JHI7 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Exosc9Q9JHI7 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Exosc9Q9JHI7 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Exosc9Q9JHI7 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Exosc9Q9JHI7 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Exosc9Q9JHI7 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Exosc9Q9JHI7 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Exosc9Q9JHI7 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Exosc9Q9JHI7 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Exosc9Q9JHI7 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Exosc9Q9JHI7 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Exosc9Q9JHI7 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Exosc9Q9JHI7 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Exosc9Q9JHI7 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Exosc9Q9JHI7 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Exosc9Q9JHI7 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Exosc9Q9JHI7 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Exosc9Q9JHI7 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Exosc9Q9JHI7 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Exosc9Q9JHI7 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Exosc9Q9JHI7 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Exosc9Q9JHI7 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Exosc9Q9JHI7 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Exosc9Q9JHI7 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Exosc9Q9JHI7 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Exosc9Q9JHI7 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Exosc9Q9JHI7 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Exosc9Q9JHI7 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Exosc9Q9JHI7 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Exosc9Q9JHI7 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Exosc9Q9JHI7 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Exosc9Q9JHI7 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Exosc9Q9JHI7 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Exosc9Q9JHI7 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Exosc9Q9JHI7 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Exosc9Q9JHI7 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Exosc9Q9JHI7 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Exosc9Q9JHI7 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Exosc9Q9JHI7 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Exosc9Q9JHI7 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Exosc9Q9JHI7 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Exosc9Q9JHI7 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Exosc9Q9JHI7 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Exosc9Q9JHI7 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Exosc9Q9JHI7 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Exosc9Q9JHI7 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Exosc9Q9JHI7 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Exosc9Q9JHI7 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Exosc9Q9JHI7 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Exosc9Q9JHI7 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Exosc9Q9JHI7 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Exosc9Q9JHI7 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Exosc9Q9JHI7 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Exosc9Q9JHI7 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Exosc9Q9JHI7 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Exosc9Q9JHI7 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Exosc9Q9JHI7 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms