Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET30

Tm9sf3, Transmembrane 9 superfamily member 3, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm9sf3Q9ET30 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Tm9sf3Q9ET30 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Tm9sf3Q9ET30 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tm9sf3Q9ET30 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tm9sf3Q9ET30 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tm9sf3Q9ET30 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tm9sf3Q9ET30 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tm9sf3Q9ET30 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tm9sf3Q9ET30 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tm9sf3Q9ET30 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tm9sf3Q9ET30 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tm9sf3Q9ET30 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tm9sf3Q9ET30 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tm9sf3Q9ET30 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tm9sf3Q9ET30 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tm9sf3Q9ET30 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tm9sf3Q9ET30 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tm9sf3Q9ET30 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tm9sf3Q9ET30 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tm9sf3Q9ET30 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tm9sf3Q9ET30 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tm9sf3Q9ET30 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tm9sf3Q9ET30 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tm9sf3Q9ET30 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Tm9sf3Q9ET30 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Tm9sf3Q9ET30 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tm9sf3Q9ET30 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tm9sf3Q9ET30 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tm9sf3Q9ET30 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tm9sf3Q9ET30 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tm9sf3Q9ET30 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tm9sf3Q9ET30 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tm9sf3Q9ET30 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tm9sf3Q9ET30 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Tm9sf3Q9ET30 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tm9sf3Q9ET30 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tm9sf3Q9ET30 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tm9sf3Q9ET30 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tm9sf3Q9ET30 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tm9sf3Q9ET30 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tm9sf3Q9ET30 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tm9sf3Q9ET30 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tm9sf3Q9ET30 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tm9sf3Q9ET30 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tm9sf3Q9ET30 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tm9sf3Q9ET30 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tm9sf3Q9ET30 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tm9sf3Q9ET30 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tm9sf3Q9ET30 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tm9sf3Q9ET30 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tm9sf3Q9ET30 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tm9sf3Q9ET30 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tm9sf3Q9ET30 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Tm9sf3Q9ET30 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tm9sf3Q9ET30 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tm9sf3Q9ET30 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tm9sf3Q9ET30 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tm9sf3Q9ET30 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tm9sf3Q9ET30 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tm9sf3Q9ET30 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tm9sf3Q9ET30 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tm9sf3Q9ET30 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tm9sf3Q9ET30 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tm9sf3Q9ET30 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tm9sf3Q9ET30 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Tm9sf3Q9ET30 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tm9sf3Q9ET30 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Tm9sf3Q9ET30 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tm9sf3Q9ET30 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tm9sf3Q9ET30 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tm9sf3Q9ET30 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tm9sf3Q9ET30 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tm9sf3Q9ET30 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tm9sf3Q9ET30 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tm9sf3Q9ET30 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tm9sf3Q9ET30 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tm9sf3Q9ET30 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tm9sf3Q9ET30 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tm9sf3Q9ET30 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tm9sf3Q9ET30 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tm9sf3Q9ET30 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tm9sf3Q9ET30 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tm9sf3Q9ET30 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tm9sf3Q9ET30 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tm9sf3Q9ET30 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tm9sf3Q9ET30 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Tm9sf3Q9ET30 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tm9sf3Q9ET30 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Tm9sf3Q9ET30 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Tm9sf3Q9ET30 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tm9sf3Q9ET30 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tm9sf3Q9ET30 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Tm9sf3Q9ET30 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tm9sf3Q9ET30 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tm9sf3Q9ET30 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tm9sf3Q9ET30 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tm9sf3Q9ET30 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tm9sf3Q9ET30 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tm9sf3Q9ET30 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tm9sf3Q9ET30 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms