Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESM3

Hapln2, Hyaluronan and proteoglycan link protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hapln2Q9ESM3 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hapln2Q9ESM3 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hapln2Q9ESM3 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hapln2Q9ESM3 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hapln2Q9ESM3 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hapln2Q9ESM3 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hapln2Q9ESM3 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hapln2Q9ESM3 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hapln2Q9ESM3 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hapln2Q9ESM3 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hapln2Q9ESM3 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hapln2Q9ESM3 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hapln2Q9ESM3 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hapln2Q9ESM3 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hapln2Q9ESM3 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hapln2Q9ESM3 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hapln2Q9ESM3 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hapln2Q9ESM3 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hapln2Q9ESM3 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hapln2Q9ESM3 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hapln2Q9ESM3 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hapln2Q9ESM3 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hapln2Q9ESM3 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hapln2Q9ESM3 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hapln2Q9ESM3 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hapln2Q9ESM3 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Hapln2Q9ESM3 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hapln2Q9ESM3 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hapln2Q9ESM3 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hapln2Q9ESM3 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hapln2Q9ESM3 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hapln2Q9ESM3 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hapln2Q9ESM3 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hapln2Q9ESM3 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hapln2Q9ESM3 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hapln2Q9ESM3 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hapln2Q9ESM3 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hapln2Q9ESM3 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hapln2Q9ESM3 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hapln2Q9ESM3 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hapln2Q9ESM3 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Hapln2Q9ESM3 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hapln2Q9ESM3 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hapln2Q9ESM3 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hapln2Q9ESM3 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Hapln2Q9ESM3 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hapln2Q9ESM3 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hapln2Q9ESM3 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hapln2Q9ESM3 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hapln2Q9ESM3 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hapln2Q9ESM3 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hapln2Q9ESM3 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Hapln2Q9ESM3 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hapln2Q9ESM3 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hapln2Q9ESM3 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hapln2Q9ESM3 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hapln2Q9ESM3 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hapln2Q9ESM3 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hapln2Q9ESM3 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hapln2Q9ESM3 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hapln2Q9ESM3 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Hapln2Q9ESM3 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hapln2Q9ESM3 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hapln2Q9ESM3 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hapln2Q9ESM3 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hapln2Q9ESM3 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hapln2Q9ESM3 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hapln2Q9ESM3 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hapln2Q9ESM3 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hapln2Q9ESM3 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Hapln2Q9ESM3 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hapln2Q9ESM3 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hapln2Q9ESM3 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hapln2Q9ESM3 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hapln2Q9ESM3 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Hapln2Q9ESM3 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hapln2Q9ESM3 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hapln2Q9ESM3 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hapln2Q9ESM3 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hapln2Q9ESM3 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hapln2Q9ESM3 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hapln2Q9ESM3 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hapln2Q9ESM3 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hapln2Q9ESM3 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hapln2Q9ESM3 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hapln2Q9ESM3 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hapln2Q9ESM3 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hapln2Q9ESM3 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hapln2Q9ESM3 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hapln2Q9ESM3 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hapln2Q9ESM3 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hapln2Q9ESM3 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hapln2Q9ESM3 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hapln2Q9ESM3 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hapln2Q9ESM3 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hapln2Q9ESM3 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hapln2Q9ESM3 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hapln2Q9ESM3 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hapln2Q9ESM3 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hapln2Q9ESM3 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms