Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERA6

Tfip11, Tuftelin-interacting protein 11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 838 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfip11Q9ERA6 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tfip11Q9ERA6 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tfip11Q9ERA6 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tfip11Q9ERA6 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Tfip11Q9ERA6 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tfip11Q9ERA6 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tfip11Q9ERA6 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tfip11Q9ERA6 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tfip11Q9ERA6 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tfip11Q9ERA6 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tfip11Q9ERA6 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tfip11Q9ERA6 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tfip11Q9ERA6 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tfip11Q9ERA6 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tfip11Q9ERA6 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tfip11Q9ERA6 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tfip11Q9ERA6 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tfip11Q9ERA6 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tfip11Q9ERA6 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tfip11Q9ERA6 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tfip11Q9ERA6 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Tfip11Q9ERA6 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tfip11Q9ERA6 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tfip11Q9ERA6 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tfip11Q9ERA6 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tfip11Q9ERA6 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tfip11Q9ERA6 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Tfip11Q9ERA6 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Tfip11Q9ERA6 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Tfip11Q9ERA6 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Tfip11Q9ERA6 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tfip11Q9ERA6 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Tfip11Q9ERA6 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tfip11Q9ERA6 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tfip11Q9ERA6 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tfip11Q9ERA6 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tfip11Q9ERA6 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tfip11Q9ERA6 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tfip11Q9ERA6 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tfip11Q9ERA6 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tfip11Q9ERA6 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Tfip11Q9ERA6 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tfip11Q9ERA6 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tfip11Q9ERA6 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tfip11Q9ERA6 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tfip11Q9ERA6 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tfip11Q9ERA6 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tfip11Q9ERA6 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tfip11Q9ERA6 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tfip11Q9ERA6 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tfip11Q9ERA6 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tfip11Q9ERA6 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tfip11Q9ERA6 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tfip11Q9ERA6 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tfip11Q9ERA6 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tfip11Q9ERA6 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tfip11Q9ERA6 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tfip11Q9ERA6 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tfip11Q9ERA6 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tfip11Q9ERA6 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Tfip11Q9ERA6 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tfip11Q9ERA6 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tfip11Q9ERA6 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tfip11Q9ERA6 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tfip11Q9ERA6 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tfip11Q9ERA6 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tfip11Q9ERA6 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tfip11Q9ERA6 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Tfip11Q9ERA6 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tfip11Q9ERA6 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tfip11Q9ERA6 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tfip11Q9ERA6 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tfip11Q9ERA6 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tfip11Q9ERA6 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tfip11Q9ERA6 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Tfip11Q9ERA6 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tfip11Q9ERA6 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tfip11Q9ERA6 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tfip11Q9ERA6 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tfip11Q9ERA6 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Tfip11Q9ERA6 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tfip11Q9ERA6 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tfip11Q9ERA6 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tfip11Q9ERA6 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tfip11Q9ERA6 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tfip11Q9ERA6 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tfip11Q9ERA6 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tfip11Q9ERA6 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tfip11Q9ERA6 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tfip11Q9ERA6 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tfip11Q9ERA6 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tfip11Q9ERA6 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tfip11Q9ERA6 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tfip11Q9ERA6 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tfip11Q9ERA6 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tfip11Q9ERA6 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tfip11Q9ERA6 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tfip11Q9ERA6 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tfip11Q9ERA6 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tfip11Q9ERA6 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms