Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER56

Capn12, Calpain-12, mousemouse

Predictions only

Length 720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn12Q9ER56 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Capn12Q9ER56 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Capn12Q9ER56 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Capn12Q9ER56 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Capn12Q9ER56 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Capn12Q9ER56 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Capn12Q9ER56 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Capn12Q9ER56 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Capn12Q9ER56 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Capn12Q9ER56 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Capn12Q9ER56 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Capn12Q9ER56 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Capn12Q9ER56 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Capn12Q9ER56 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Capn12Q9ER56 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Capn12Q9ER56 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Capn12Q9ER56 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Capn12Q9ER56 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Capn12Q9ER56 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Capn12Q9ER56 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Capn12Q9ER56 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Capn12Q9ER56 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Capn12Q9ER56 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Capn12Q9ER56 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Capn12Q9ER56 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Capn12Q9ER56 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Capn12Q9ER56 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Capn12Q9ER56 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Capn12Q9ER56 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Capn12Q9ER56 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Capn12Q9ER56 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Capn12Q9ER56 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Capn12Q9ER56 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Capn12Q9ER56 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Capn12Q9ER56 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Capn12Q9ER56 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Capn12Q9ER56 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Capn12Q9ER56 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Capn12Q9ER56 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Capn12Q9ER56 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Capn12Q9ER56 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Capn12Q9ER56 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Capn12Q9ER56 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Capn12Q9ER56 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Capn12Q9ER56 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Capn12Q9ER56 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Capn12Q9ER56 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Capn12Q9ER56 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Capn12Q9ER56 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Capn12Q9ER56 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Capn12Q9ER56 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Capn12Q9ER56 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Capn12Q9ER56 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Capn12Q9ER56 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Capn12Q9ER56 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Capn12Q9ER56 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Capn12Q9ER56 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Capn12Q9ER56 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Capn12Q9ER56 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Capn12Q9ER56 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Capn12Q9ER56 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Capn12Q9ER56 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Capn12Q9ER56 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Capn12Q9ER56 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Capn12Q9ER56 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Capn12Q9ER56 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Capn12Q9ER56 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Capn12Q9ER56 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Capn12Q9ER56 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Capn12Q9ER56 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Capn12Q9ER56 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Capn12Q9ER56 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Capn12Q9ER56 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Capn12Q9ER56 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Capn12Q9ER56 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Capn12Q9ER56 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Capn12Q9ER56 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Capn12Q9ER56 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Capn12Q9ER56 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Capn12Q9ER56 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Capn12Q9ER56 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Capn12Q9ER56 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Capn12Q9ER56 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Capn12Q9ER56 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Capn12Q9ER56 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Capn12Q9ER56 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Capn12Q9ER56 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Capn12Q9ER56 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Capn12Q9ER56 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Capn12Q9ER56 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Capn12Q9ER56 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Capn12Q9ER56 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Capn12Q9ER56 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Capn12Q9ER56 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Capn12Q9ER56 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Capn12Q9ER56 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Capn12Q9ER56 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Capn12Q9ER56 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Capn12Q9ER56 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Capn12Q9ER56 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms