Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQQ2

Yipf5, Protein YIPF5, mousemouse

Predictions only

Length 257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Yipf5Q9EQQ2 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Yipf5Q9EQQ2 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Yipf5Q9EQQ2 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Yipf5Q9EQQ2 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Yipf5Q9EQQ2 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Yipf5Q9EQQ2 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Yipf5Q9EQQ2 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Yipf5Q9EQQ2 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Yipf5Q9EQQ2 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Yipf5Q9EQQ2 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Yipf5Q9EQQ2 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Yipf5Q9EQQ2 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Yipf5Q9EQQ2 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Yipf5Q9EQQ2 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Yipf5Q9EQQ2 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Yipf5Q9EQQ2 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Yipf5Q9EQQ2 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Yipf5Q9EQQ2 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Yipf5Q9EQQ2 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Yipf5Q9EQQ2 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Yipf5Q9EQQ2 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Yipf5Q9EQQ2 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Yipf5Q9EQQ2 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Yipf5Q9EQQ2 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Yipf5Q9EQQ2 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Yipf5Q9EQQ2 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Yipf5Q9EQQ2 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Yipf5Q9EQQ2 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Yipf5Q9EQQ2 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Yipf5Q9EQQ2 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Yipf5Q9EQQ2 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Yipf5Q9EQQ2 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Yipf5Q9EQQ2 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Yipf5Q9EQQ2 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Yipf5Q9EQQ2 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Yipf5Q9EQQ2 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Yipf5Q9EQQ2 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Yipf5Q9EQQ2 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Yipf5Q9EQQ2 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Yipf5Q9EQQ2 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Yipf5Q9EQQ2 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Yipf5Q9EQQ2 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Yipf5Q9EQQ2 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Yipf5Q9EQQ2 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Yipf5Q9EQQ2 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Yipf5Q9EQQ2 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Yipf5Q9EQQ2 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Yipf5Q9EQQ2 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Yipf5Q9EQQ2 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Yipf5Q9EQQ2 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Yipf5Q9EQQ2 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Yipf5Q9EQQ2 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Yipf5Q9EQQ2 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Yipf5Q9EQQ2 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Yipf5Q9EQQ2 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Yipf5Q9EQQ2 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Yipf5Q9EQQ2 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Yipf5Q9EQQ2 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Yipf5Q9EQQ2 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Yipf5Q9EQQ2 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Yipf5Q9EQQ2 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Yipf5Q9EQQ2 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Yipf5Q9EQQ2 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Yipf5Q9EQQ2 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Yipf5Q9EQQ2 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Yipf5Q9EQQ2 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Yipf5Q9EQQ2 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Yipf5Q9EQQ2 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Yipf5Q9EQQ2 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Yipf5Q9EQQ2 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Yipf5Q9EQQ2 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Yipf5Q9EQQ2 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Yipf5Q9EQQ2 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Yipf5Q9EQQ2 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Yipf5Q9EQQ2 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Yipf5Q9EQQ2 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Yipf5Q9EQQ2 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Yipf5Q9EQQ2 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Yipf5Q9EQQ2 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Yipf5Q9EQQ2 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Yipf5Q9EQQ2 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Yipf5Q9EQQ2 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Yipf5Q9EQQ2 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Yipf5Q9EQQ2 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Yipf5Q9EQQ2 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Yipf5Q9EQQ2 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Yipf5Q9EQQ2 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Yipf5Q9EQQ2 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Yipf5Q9EQQ2 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Yipf5Q9EQQ2 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Yipf5Q9EQQ2 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Yipf5Q9EQQ2 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Yipf5Q9EQQ2 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Yipf5Q9EQQ2 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Yipf5Q9EQQ2 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Yipf5Q9EQQ2 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Yipf5Q9EQQ2 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Yipf5Q9EQQ2 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Yipf5Q9EQQ2 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Yipf5Q9EQQ2 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms