Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ08

Sgsh, Heparan N-sulfatase, mousemouse

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgshQ9EQ08 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SgshQ9EQ08 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SgshQ9EQ08 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SgshQ9EQ08 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SgshQ9EQ08 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SgshQ9EQ08 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SgshQ9EQ08 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SgshQ9EQ08 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SgshQ9EQ08 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SgshQ9EQ08 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SgshQ9EQ08 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SgshQ9EQ08 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SgshQ9EQ08 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SgshQ9EQ08 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SgshQ9EQ08 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SgshQ9EQ08 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SgshQ9EQ08 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SgshQ9EQ08 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SgshQ9EQ08 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SgshQ9EQ08 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SgshQ9EQ08 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SgshQ9EQ08 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SgshQ9EQ08 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SgshQ9EQ08 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SgshQ9EQ08 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SgshQ9EQ08 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SgshQ9EQ08 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SgshQ9EQ08 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SgshQ9EQ08 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SgshQ9EQ08 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SgshQ9EQ08 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SgshQ9EQ08 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SgshQ9EQ08 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SgshQ9EQ08 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SgshQ9EQ08 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SgshQ9EQ08 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SgshQ9EQ08 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SgshQ9EQ08 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SgshQ9EQ08 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SgshQ9EQ08 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SgshQ9EQ08 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SgshQ9EQ08 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SgshQ9EQ08 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SgshQ9EQ08 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SgshQ9EQ08 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SgshQ9EQ08 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SgshQ9EQ08 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SgshQ9EQ08 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SgshQ9EQ08 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SgshQ9EQ08 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SgshQ9EQ08 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SgshQ9EQ08 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SgshQ9EQ08 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SgshQ9EQ08 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SgshQ9EQ08 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SgshQ9EQ08 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SgshQ9EQ08 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SgshQ9EQ08 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SgshQ9EQ08 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SgshQ9EQ08 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SgshQ9EQ08 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SgshQ9EQ08 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SgshQ9EQ08 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SgshQ9EQ08 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SgshQ9EQ08 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SgshQ9EQ08 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SgshQ9EQ08 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SgshQ9EQ08 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SgshQ9EQ08 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SgshQ9EQ08 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SgshQ9EQ08 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SgshQ9EQ08 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SgshQ9EQ08 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SgshQ9EQ08 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SgshQ9EQ08 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SgshQ9EQ08 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SgshQ9EQ08 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SgshQ9EQ08 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SgshQ9EQ08 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SgshQ9EQ08 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SgshQ9EQ08 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SgshQ9EQ08 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SgshQ9EQ08 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SgshQ9EQ08 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SgshQ9EQ08 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SgshQ9EQ08 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SgshQ9EQ08 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SgshQ9EQ08 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SgshQ9EQ08 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SgshQ9EQ08 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SgshQ9EQ08 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SgshQ9EQ08 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SgshQ9EQ08 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SgshQ9EQ08 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SgshQ9EQ08 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SgshQ9EQ08 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SgshQ9EQ08 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SgshQ9EQ08 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SgshQ9EQ08 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SgshQ9EQ08 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms