Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPU4

Cpsf1, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpsf1Q9EPU4 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Cpsf1Q9EPU4 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cpsf1Q9EPU4 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Cpsf1Q9EPU4 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Cpsf1Q9EPU4 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Cpsf1Q9EPU4 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cpsf1Q9EPU4 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cpsf1Q9EPU4 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cpsf1Q9EPU4 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cpsf1Q9EPU4 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cpsf1Q9EPU4 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cpsf1Q9EPU4 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Cpsf1Q9EPU4 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Cpsf1Q9EPU4 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cpsf1Q9EPU4 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cpsf1Q9EPU4 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cpsf1Q9EPU4 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cpsf1Q9EPU4 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Cpsf1Q9EPU4 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cpsf1Q9EPU4 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cpsf1Q9EPU4 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cpsf1Q9EPU4 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cpsf1Q9EPU4 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cpsf1Q9EPU4 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cpsf1Q9EPU4 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cpsf1Q9EPU4 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cpsf1Q9EPU4 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cpsf1Q9EPU4 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cpsf1Q9EPU4 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Cpsf1Q9EPU4 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cpsf1Q9EPU4 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cpsf1Q9EPU4 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cpsf1Q9EPU4 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cpsf1Q9EPU4 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cpsf1Q9EPU4 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cpsf1Q9EPU4 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cpsf1Q9EPU4 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cpsf1Q9EPU4 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cpsf1Q9EPU4 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cpsf1Q9EPU4 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cpsf1Q9EPU4 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cpsf1Q9EPU4 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cpsf1Q9EPU4 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cpsf1Q9EPU4 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cpsf1Q9EPU4 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Cpsf1Q9EPU4 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Cpsf1Q9EPU4 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Cpsf1Q9EPU4 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
Cpsf1Q9EPU4 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Cpsf1Q9EPU4 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Cpsf1Q9EPU4 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cpsf1Q9EPU4 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cpsf1Q9EPU4 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cpsf1Q9EPU4 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Cpsf1Q9EPU4 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cpsf1Q9EPU4 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cpsf1Q9EPU4 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cpsf1Q9EPU4 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Cpsf1Q9EPU4 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cpsf1Q9EPU4 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cpsf1Q9EPU4 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cpsf1Q9EPU4 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cpsf1Q9EPU4 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cpsf1Q9EPU4 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cpsf1Q9EPU4 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cpsf1Q9EPU4 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cpsf1Q9EPU4 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cpsf1Q9EPU4 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cpsf1Q9EPU4 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cpsf1Q9EPU4 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cpsf1Q9EPU4 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cpsf1Q9EPU4 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cpsf1Q9EPU4 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cpsf1Q9EPU4 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cpsf1Q9EPU4 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cpsf1Q9EPU4 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cpsf1Q9EPU4 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cpsf1Q9EPU4 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cpsf1Q9EPU4 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cpsf1Q9EPU4 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cpsf1Q9EPU4 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cpsf1Q9EPU4 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Cpsf1Q9EPU4 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cpsf1Q9EPU4 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cpsf1Q9EPU4 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Cpsf1Q9EPU4 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cpsf1Q9EPU4 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cpsf1Q9EPU4 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Cpsf1Q9EPU4 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Cpsf1Q9EPU4 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cpsf1Q9EPU4 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cpsf1Q9EPU4 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cpsf1Q9EPU4 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cpsf1Q9EPU4 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cpsf1Q9EPU4 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cpsf1Q9EPU4 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cpsf1Q9EPU4 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cpsf1Q9EPU4 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Cpsf1Q9EPU4 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cpsf1Q9EPU4 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms