Protein–RNA interactions for Protein: Q9EP82

Wdr4, tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase non-catalytic subunit WDR4, mousemouse

Predictions only

Length 413 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr4Q9EP82 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Wdr4Q9EP82 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Wdr4Q9EP82 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Wdr4Q9EP82 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Wdr4Q9EP82 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Wdr4Q9EP82 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Wdr4Q9EP82 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Wdr4Q9EP82 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Wdr4Q9EP82 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Wdr4Q9EP82 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Wdr4Q9EP82 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Wdr4Q9EP82 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Wdr4Q9EP82 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Wdr4Q9EP82 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Wdr4Q9EP82 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Wdr4Q9EP82 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Wdr4Q9EP82 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Wdr4Q9EP82 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Wdr4Q9EP82 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Wdr4Q9EP82 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Wdr4Q9EP82 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Wdr4Q9EP82 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Wdr4Q9EP82 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Wdr4Q9EP82 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Wdr4Q9EP82 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Wdr4Q9EP82 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Wdr4Q9EP82 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Wdr4Q9EP82 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Wdr4Q9EP82 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Wdr4Q9EP82 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Wdr4Q9EP82 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Wdr4Q9EP82 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Wdr4Q9EP82 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Wdr4Q9EP82 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Wdr4Q9EP82 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Wdr4Q9EP82 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Wdr4Q9EP82 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Wdr4Q9EP82 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Wdr4Q9EP82 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Wdr4Q9EP82 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Wdr4Q9EP82 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Wdr4Q9EP82 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Wdr4Q9EP82 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Wdr4Q9EP82 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Wdr4Q9EP82 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Wdr4Q9EP82 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Wdr4Q9EP82 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Wdr4Q9EP82 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Wdr4Q9EP82 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Wdr4Q9EP82 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Wdr4Q9EP82 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Wdr4Q9EP82 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Wdr4Q9EP82 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Wdr4Q9EP82 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Wdr4Q9EP82 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Wdr4Q9EP82 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Wdr4Q9EP82 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Wdr4Q9EP82 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Wdr4Q9EP82 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Wdr4Q9EP82 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Wdr4Q9EP82 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Wdr4Q9EP82 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Wdr4Q9EP82 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Wdr4Q9EP82 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Wdr4Q9EP82 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Wdr4Q9EP82 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Wdr4Q9EP82 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Wdr4Q9EP82 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Wdr4Q9EP82 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Wdr4Q9EP82 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Wdr4Q9EP82 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Wdr4Q9EP82 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Wdr4Q9EP82 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Wdr4Q9EP82 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Wdr4Q9EP82 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Wdr4Q9EP82 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Wdr4Q9EP82 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Wdr4Q9EP82 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Wdr4Q9EP82 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Wdr4Q9EP82 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Wdr4Q9EP82 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Wdr4Q9EP82 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Wdr4Q9EP82 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Wdr4Q9EP82 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Wdr4Q9EP82 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Wdr4Q9EP82 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Wdr4Q9EP82 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Wdr4Q9EP82 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Wdr4Q9EP82 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Wdr4Q9EP82 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Wdr4Q9EP82 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Wdr4Q9EP82 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Wdr4Q9EP82 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Wdr4Q9EP82 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Wdr4Q9EP82 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Wdr4Q9EP82 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Wdr4Q9EP82 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Wdr4Q9EP82 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Wdr4Q9EP82 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Wdr4Q9EP82 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms