Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCZ9

Aph1c, Putative gamma-secretase subunit APH-1C, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aph1cQ9DCZ9 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Aph1cQ9DCZ9 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Aph1cQ9DCZ9 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Aph1cQ9DCZ9 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Aph1cQ9DCZ9 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Aph1cQ9DCZ9 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Aph1cQ9DCZ9 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Aph1cQ9DCZ9 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Aph1cQ9DCZ9 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Aph1cQ9DCZ9 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Aph1cQ9DCZ9 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Aph1cQ9DCZ9 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Aph1cQ9DCZ9 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Aph1cQ9DCZ9 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Aph1cQ9DCZ9 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Aph1cQ9DCZ9 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Aph1cQ9DCZ9 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Aph1cQ9DCZ9 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Aph1cQ9DCZ9 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Aph1cQ9DCZ9 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Aph1cQ9DCZ9 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Aph1cQ9DCZ9 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Aph1cQ9DCZ9 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Aph1cQ9DCZ9 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Aph1cQ9DCZ9 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Aph1cQ9DCZ9 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Aph1cQ9DCZ9 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Aph1cQ9DCZ9 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Aph1cQ9DCZ9 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Aph1cQ9DCZ9 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Aph1cQ9DCZ9 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Aph1cQ9DCZ9 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Aph1cQ9DCZ9 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Aph1cQ9DCZ9 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Aph1cQ9DCZ9 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Aph1cQ9DCZ9 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Aph1cQ9DCZ9 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Aph1cQ9DCZ9 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Aph1cQ9DCZ9 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Aph1cQ9DCZ9 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Aph1cQ9DCZ9 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Aph1cQ9DCZ9 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Aph1cQ9DCZ9 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Aph1cQ9DCZ9 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Aph1cQ9DCZ9 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Aph1cQ9DCZ9 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Aph1cQ9DCZ9 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Aph1cQ9DCZ9 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Aph1cQ9DCZ9 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Aph1cQ9DCZ9 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Aph1cQ9DCZ9 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Aph1cQ9DCZ9 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Aph1cQ9DCZ9 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Aph1cQ9DCZ9 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Aph1cQ9DCZ9 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Aph1cQ9DCZ9 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Aph1cQ9DCZ9 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Aph1cQ9DCZ9 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Aph1cQ9DCZ9 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Aph1cQ9DCZ9 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Aph1cQ9DCZ9 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Aph1cQ9DCZ9 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Aph1cQ9DCZ9 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Aph1cQ9DCZ9 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Aph1cQ9DCZ9 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Aph1cQ9DCZ9 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Aph1cQ9DCZ9 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Aph1cQ9DCZ9 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Aph1cQ9DCZ9 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Aph1cQ9DCZ9 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Aph1cQ9DCZ9 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Aph1cQ9DCZ9 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Aph1cQ9DCZ9 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Aph1cQ9DCZ9 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Aph1cQ9DCZ9 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Aph1cQ9DCZ9 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Aph1cQ9DCZ9 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Aph1cQ9DCZ9 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Aph1cQ9DCZ9 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Aph1cQ9DCZ9 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Aph1cQ9DCZ9 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Aph1cQ9DCZ9 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Aph1cQ9DCZ9 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Aph1cQ9DCZ9 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Aph1cQ9DCZ9 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Aph1cQ9DCZ9 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Aph1cQ9DCZ9 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Aph1cQ9DCZ9 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Aph1cQ9DCZ9 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Aph1cQ9DCZ9 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Aph1cQ9DCZ9 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Aph1cQ9DCZ9 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Aph1cQ9DCZ9 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Aph1cQ9DCZ9 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Aph1cQ9DCZ9 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Aph1cQ9DCZ9 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Aph1cQ9DCZ9 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Aph1cQ9DCZ9 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Aph1cQ9DCZ9 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Aph1cQ9DCZ9 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms