Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCT5

Sdf2, Stromal cell-derived factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdf2Q9DCT5 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sdf2Q9DCT5 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sdf2Q9DCT5 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sdf2Q9DCT5 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sdf2Q9DCT5 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sdf2Q9DCT5 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sdf2Q9DCT5 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sdf2Q9DCT5 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sdf2Q9DCT5 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sdf2Q9DCT5 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sdf2Q9DCT5 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sdf2Q9DCT5 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sdf2Q9DCT5 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sdf2Q9DCT5 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sdf2Q9DCT5 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sdf2Q9DCT5 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sdf2Q9DCT5 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sdf2Q9DCT5 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sdf2Q9DCT5 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sdf2Q9DCT5 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sdf2Q9DCT5 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sdf2Q9DCT5 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sdf2Q9DCT5 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sdf2Q9DCT5 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sdf2Q9DCT5 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sdf2Q9DCT5 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sdf2Q9DCT5 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sdf2Q9DCT5 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sdf2Q9DCT5 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sdf2Q9DCT5 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sdf2Q9DCT5 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sdf2Q9DCT5 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sdf2Q9DCT5 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sdf2Q9DCT5 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sdf2Q9DCT5 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sdf2Q9DCT5 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sdf2Q9DCT5 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Sdf2Q9DCT5 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sdf2Q9DCT5 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sdf2Q9DCT5 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sdf2Q9DCT5 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sdf2Q9DCT5 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Sdf2Q9DCT5 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Sdf2Q9DCT5 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sdf2Q9DCT5 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sdf2Q9DCT5 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sdf2Q9DCT5 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sdf2Q9DCT5 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sdf2Q9DCT5 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sdf2Q9DCT5 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sdf2Q9DCT5 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sdf2Q9DCT5 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sdf2Q9DCT5 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sdf2Q9DCT5 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sdf2Q9DCT5 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sdf2Q9DCT5 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sdf2Q9DCT5 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sdf2Q9DCT5 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sdf2Q9DCT5 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sdf2Q9DCT5 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sdf2Q9DCT5 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sdf2Q9DCT5 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sdf2Q9DCT5 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sdf2Q9DCT5 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sdf2Q9DCT5 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Sdf2Q9DCT5 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sdf2Q9DCT5 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sdf2Q9DCT5 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sdf2Q9DCT5 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sdf2Q9DCT5 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sdf2Q9DCT5 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Sdf2Q9DCT5 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sdf2Q9DCT5 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sdf2Q9DCT5 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sdf2Q9DCT5 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sdf2Q9DCT5 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sdf2Q9DCT5 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sdf2Q9DCT5 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sdf2Q9DCT5 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sdf2Q9DCT5 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sdf2Q9DCT5 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sdf2Q9DCT5 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sdf2Q9DCT5 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sdf2Q9DCT5 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sdf2Q9DCT5 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sdf2Q9DCT5 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sdf2Q9DCT5 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sdf2Q9DCT5 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Sdf2Q9DCT5 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sdf2Q9DCT5 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Sdf2Q9DCT5 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sdf2Q9DCT5 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sdf2Q9DCT5 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sdf2Q9DCT5 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sdf2Q9DCT5 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sdf2Q9DCT5 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sdf2Q9DCT5 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sdf2Q9DCT5 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sdf2Q9DCT5 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sdf2Q9DCT5 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms